Nature子刊發(fā)布癌癥外顯子組測序新成果
日期:2013-10-14 10:20:10
來自西班牙的研究人員確定了與膀胱癌相關(guān)的一些新遺傳信號通路和新基因;了解這些患者的遺傳標(biāo)記是朝著認(rèn)識這一疾病的生物學(xué),改善患者治療邁出的第一步。這項(xiàng)研究發(fā)表在《自然遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志上。
膀胱癌在許多的國家,尤其在西班牙是一種嚴(yán)重的公共健康問題。在西班牙每年記錄有11,200新增病例,是全球發(fā)病率最高的地區(qū)之一。大多數(shù)膀胱癌預(yù)后良好,確診后的五年生存率為70-80%,大約80%的病例確診時還沒有浸潤膀胱肌。
盡管如此,許多的腫瘤會出現(xiàn)復(fù)發(fā),需要定期鏡檢進(jìn)行腫瘤監(jiān)測。這類后續(xù)追蹤觀察影響了患者的生活質(zhì)量,同時也帶來了顯著的醫(yī)療費(fèi)用。
西班牙國家癌癥研究中心(CNIO)上皮癌研究組負(fù)責(zé)人Francisco X. Real,以及遺傳與分子流行病學(xué)研究組負(fù)責(zé)人Nuria Malats,協(xié)調(diào)研究人員對非浸潤性膀胱癌進(jìn)行了首次外顯子組測序。非浸潤性膀胱癌是最常見的膀胱癌類型,并且具有最高的復(fù)發(fā)風(fēng)險。
研究結(jié)果揭示了一些與疾病相關(guān)的如細(xì)胞分裂和DNA修復(fù)等新遺傳信號通路,,以及新基因,這對于了解它的起源和進(jìn)化有可能是至關(guān)重要的。
研究的主要作者、Real實(shí)驗(yàn)室的博士后研究人員Cristina Balbás說:“我們對于膀胱癌的生物學(xué)所知甚少,這些信息對于分類患者、預(yù)測復(fù)發(fā)甚至是阻止疾病都將是有用的。”
該研究對來自17名確診膀胱癌患者的外顯子組進(jìn)行了分析,隨后通過在另外的60名患者中檢測一組特定基因驗(yàn)證了這一數(shù)據(jù)。
“我們發(fā)現(xiàn)了9個此前未曾在這類腫瘤種描述過的變異基因,其中我們發(fā)現(xiàn)STAG2在大約40%的最小侵襲性腫瘤中失活,”Real說。
研究人員補(bǔ)充說:“其中一些基因與從前未曾在膀胱癌中描述過的、一些如細(xì)胞分裂和DNA修復(fù)遺傳信號通路有關(guān);我們還證實(shí)并擴(kuò)展了其他一些過去曾在這種癌癥類型中描述過的遺傳信號通路,如染色質(zhì)重塑。”
膀胱癌中的一個未知因子
“2年前STAG2基因被發(fā)現(xiàn)與癌癥相關(guān),但對于它知之甚少,它與膀胱癌的關(guān)系我們也一無所知,”Balbás說。以往的研究表明在細(xì)胞分裂過程中它參與了染色體分離,這或許是它與癌癥相關(guān)之處,并且它還被證實(shí)與DNA的3D結(jié)構(gòu)維持以及基因表達(dá)相關(guān)。
根據(jù)Real所說,與預(yù)計(jì)的相反,這篇論文揭示這一基因變異的腫瘤染色體數(shù)目往往不發(fā)生改變,這表明這一基因是通過染色體分離之外的不同機(jī)制參與了膀胱癌。
作者們還通過分析670多名患者的腫瘤樣本,發(fā)現(xiàn)STAG2變異與預(yù)后較好患者的腫瘤相關(guān)。