今天，《自然》（Nature）出版社公布了迄今為止最大規(guī)模的群體基因組測(cè)序成果。一系列描述這些數(shù)據(jù)的資源及應(yīng)用的研究論文同時(shí)發(fā)布在Nature、Nature Genetics、Bioinformatics和Nature Communications雜志上。

罕見(jiàn)遺傳變異是指群體中相對(duì)較少的人所攜帶的DNA改變。英國(guó)萬(wàn)人基因組計(jì)劃(UK10K)的目的旨在探討這些罕見(jiàn)遺傳變異對(duì)人類疾病及其風(fēng)險(xiǎn)因素的貢獻(xiàn)。

來(lái)自維康信托基金會(huì)桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）的通訊作者Nicole Soranzo博士說(shuō)：“這一計(jì)劃為闡明罕見(jiàn)遺傳變異在廣泛疾病及人類性狀中所起的作用做出了重要的新貢獻(xiàn)。它表明對(duì)高外顯率的罕見(jiàn)疾病測(cè)序幾千人具有高度的價(jià)值，但在未來(lái)的研究中對(duì)于復(fù)雜性狀和疾病將需要更大的樣本量。這一計(jì)劃生成的數(shù)據(jù)和結(jié)果將幫助到這些將來(lái)的研究工作。”

該項(xiàng)目研究了近萬(wàn)名健康或受到疾病影響的個(gè)體。這些個(gè)體罹患的疾病包括在家族中遺傳的非常罕見(jiàn)的疾病，以及諸如自閉癥、精神分裂癥和肥胖等較為常見(jiàn)的疾病。在健康人群中研究了64個(gè)不同的生物醫(yī)學(xué)風(fēng)險(xiǎn)因子如血壓或膽固醇水平等。通過(guò)確定這些個(gè)體DNA序列的特征，這一項(xiàng)目獲得了一些罕見(jiàn)變異對(duì)廣泛疾病貢獻(xiàn)的新見(jiàn)解，并發(fā)現(xiàn)了一些新的疾病風(fēng)險(xiǎn)潛在遺傳變異及基因。

桑格研究所資深UK10K研究人員Richard Durbin說(shuō)：“UK10K提高了遺傳發(fā)現(xiàn)的分辨率。它使得能夠獲取英國(guó)群體基因組內(nèi)更密集的變異，可以利用它來(lái)讓我們更深入地了解變異對(duì)于表型性狀的遺傳影響。在早期的研究中只能分析具有大影響的極罕見(jiàn)變異或是通常只有小影響的常見(jiàn)變異。現(xiàn)在我們能夠探索極罕見(jiàn)變異與常見(jiàn)變異之間變異譜中更多的部分。”

發(fā)表在今天Nature和Nature Genetics雜志上的一系列文章，證實(shí)了這些數(shù)據(jù)對(duì)于遺傳發(fā)現(xiàn)的價(jià)值。

隨著研究努力繼續(xù)不斷地確定復(fù)雜疾病的遺傳基礎(chǔ)，這項(xiàng)研究的數(shù)據(jù)和結(jié)果有望促成新一波的研究發(fā)現(xiàn)。發(fā)布在Nature Communications雜志上的一篇姊妹研究論文更加詳細(xì)地描述了UK10K序列參考面板，其可大大提高全球研究團(tuán)體鑒別大群體樣本中罕見(jiàn)變異的能力。這一資源將使得研究人員能夠‘填補(bǔ)’低分辨率基因型研究漏失的數(shù)據(jù)，使得他們能夠更快速、廉價(jià)地探索全基因型。

此外，作者們?cè)?span lang="EN-US">Bioinformatics雜志的一篇姊妹論文中描述，開(kāi)發(fā)出了基于Dalliance平臺(tái)的一個(gè)關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)瀏覽器。這一基因組瀏覽器使得能夠容易地檢索到研究中分析的所有疾病風(fēng)險(xiǎn)性狀的關(guān)聯(lián)結(jié)果。調(diào)查這一特異疾病風(fēng)險(xiǎn)因子的科學(xué)家們將能夠直接訪問(wèn)個(gè)體DNA序列結(jié)果，看看他們擁有的遺傳變異有多常見(jiàn)，這些變異與哪些性狀有關(guān)聯(lián)。

桑格研究所主要作者Klaudia Walter說(shuō)：“這一UK10K計(jì)劃是一個(gè)龐大的工程，其為未來(lái)的研究奠定了基礎(chǔ)。”