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Cell綜述:RNA修飾的新作用

日期:2014-09-03 09:11:21

 

迄今為止,科學家們已經發現了上百種RNA修飾類型,但是其中大多數在mRNA和調控非編碼RNAs中還是很罕見的。近期的一些研究發現指出,這些修飾中有至少有一些含量豐富,且保守性強。本期Cell雜志以此為中心,介紹了兩種RNA修飾方式的分子機制,和生物學功能。

 

這兩種RNA修飾方式分別是N6-甲基腺苷化修飾(N6-methyladenosine, m6A),以及尿苷化修飾uridylationU-tail)。前者也就是第5個堿基——N6-甲基腺苷(m6A)。

 

這種修飾方式是在2012年,由來自康奈爾大學維爾醫學院的研究人員發現的,當時研究人員發現長期被視作是生成蛋白質的簡單藍圖的信使RNA(mRNA),它的一個堿基腺嘌呤上往往會被添加一個甲基(methyl group)而發生化學修飾。過去mRNA被認為只包含4個堿基,這一研究表明第5個堿基——N6-甲基腺苷(m6A)遍布轉錄組。研究人員發現高達20%的人類mRNA常規發生了甲基化。超過5000種不同的mRNA分子包含m6A,這意味著這種修飾有可能廣泛的影響了基因的表達模式。

 

而且更重要的是,研究人員發現m6A存在于與人類疾病相關的基因編碼的大量mRNAs中,包括癌癥和幾種腦疾病例如自閉癥、阿爾茨海默氏癥和精神分裂癥,這表明這種修飾可以作為疾病治療的靶標。

 

此后陸續的一些研究表明這種RNA修飾具有許多重要的功能,如今年1月,研究人員發現這種修飾的一個主要功能是控制RNA的壽命和降解,這一過程對于健康細胞發育極為重要。

 

RNA壽命延長將會導致生成更多的蛋白。如果這一去甲基化機制存在缺陷,就有可能大大地影響你的細胞蛋白質水平。其中的一些蛋白質有可能對于人類機體的能量調控至關重要,影響了肥胖。這一研究揭示了mRNA上的m6A修飾如何影響mRNA的半衰期轉而調控細胞蛋白質數量的機制。

 

近來還有研究者發現,通過減少m6A甲基化酶來抑制甲基化會擾亂生物鐘,使生物鐘周期延長。而過表達這種甲基化酶會使周期縮短。研究顯示,當m6A甲基化被抑制時,細胞核的mRNA輸出受到延遲。此外細胞中還出現了廣泛的mRNA穩定化,特別是與生物鐘有關的蛋白編碼mRNA

 

而另外一種修飾方式:尿苷化(uridylationU-tail)也具有一些特殊作用。2012年,研究人員發現了miRNAs生物形成途徑中的一名新成員:尿苷化轉移酶TUT7/4/2,并與之前研究成果結合,證明了尿苷化的雙重作用。

 

在這篇文章中,研究人員發現與標準的pre-miRNAsgroup I,一類)不同,二類(group IIpre-miRNAs需要Drosha酶加工出一種更短的3’突出端——僅1 nt長,因此需要Dicer酶加工過程的3端單尿苷化(mono-uridylation)。而且值得注意到是,對于癌癥發生發展具有重要意義的let-7miR-105兩種miRNAs,其大部分都屬于二類pre-miRNAs

 

這些研究結果均表明了尿苷化的雙重作用,并指出 TUT7/4/2參與了miRNAs生物形成途徑,是這一途徑中的一名新成員。

 

為了能完成精確沉默各種不同mRNA的任務,生物機體需要通過加工過程和成熟后處理等多種微調機制,確保其穩定性和有效性。了解RNA的修飾過程,將有助于科學家們解析這一作用機制,以及這一機制出現問題后,如果進行彌補。

 


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