改善乳腺癌治療的更好分類法
日期:2014-08-29 08:56:58
最近,根據(jù)科學家開發(fā)出的一種新工具,可以將乳腺癌分類為十種不同的亞型。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2014年8月28日的《Genome Biology》雜志,有望改善這種疾病的治療效果。
癌癥的產(chǎn)生,是因為遺傳變化致使正常細胞發(fā)展為腫瘤。隨著我們對乳腺癌的了解增多,我們知道,這不是一種單一的疾病——引起不同類型癌癥的基因突變是不一樣的,這就是為什么腫瘤對治療的反應(yīng)有所差異,為什么它們會以不同的速度生長。目前,有兩個關(guān)鍵的指標,臨床醫(yī)生用其來預(yù)測治療療效。
發(fā)現(xiàn)腫瘤遺傳學的研究動態(tài),并創(chuàng)建一種系統(tǒng)來診斷腫瘤類型,是癌癥科學家們的一個主要目標。為此,英國癌癥研究所和劍橋大學的研究人員,開發(fā)了IntClust系統(tǒng),該系統(tǒng)利用基因組技術(shù)來創(chuàng)建一種分類系統(tǒng),該分類系統(tǒng)具有足夠的細節(jié),能夠更準確地指出患者得的是哪種類型的乳腺癌,從而確定哪種治療方法將是最合適的。
為了檢測這個系統(tǒng),科學家們分析了他們開發(fā)系統(tǒng)所用的997份腫瘤樣本,以及來自公共數(shù)據(jù)庫的7544份樣本,連同基因組和臨床數(shù)據(jù),包括來自The Cancer Genome Atlas的數(shù)據(jù)。他們使用IntClust系統(tǒng)和今天使用的兩個主要系統(tǒng):PAM50,其將癌癥分成五種類型;和SCMGENE,其將癌癥分成4種類型,對這些數(shù)據(jù)進行分類。
他們發(fā)現(xiàn),至少在預(yù)測患者預(yù)后和治療療效方面,IntClust與現(xiàn)有的系統(tǒng)無異。但是這個系統(tǒng)只在3.1%具有較差存活率的女性當中,識別出一個以前沒有注意到的子群,這些患者似乎對治療具有抵抗性。識別這一患者組的基因組標簽,就能夠在早期標記這些高風險的癌癥,獲得這一組患者的基因組數(shù)據(jù),就可能有助于研究新的方法,治療這種類型的癌癥。
目前,利用該系統(tǒng)對腫瘤進行分類,對于大多數(shù)臨床醫(yī)生還是昂貴的,并且,解釋這些結(jié)果業(yè)需要許多臨床設(shè)置達不到的訓練。但是,這一系統(tǒng)的細節(jié)和精度,可能對乳腺癌研究人員具有廣泛的用處,他們將能夠調(diào)查之所以某類癌癥對某些治療方法反應(yīng)較好的原因,以便尋找乳腺癌的臨床標記,或發(fā)現(xiàn)其新的治療靶點。
本文第一作者、英國癌癥研究所的Raza Ali稱:“我們開發(fā)了一種基于表達的方法,將乳腺腫瘤分類成IntClust亞型。我們的研究結(jié)果強調(diào)了這一方法在靶向治療時代的潛力,為將腫瘤分為IntClust亞型的新一代臨床試驗,奠定了基礎(chǔ)。”
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