Nature新文章:生命起源于“RNA世界”
日期:2013-11-07 09:07:42
來自芝加哥大學的科學家們在《自然》(Nature)雜志上報告稱,RNA是控制基因表達的分子機器——剪接體的重要功能元件。這一研究發現確立了是RNA,而非蛋白質,負責催化了這一基礎生物學過程,豐富了地球上的生命起源于僅以RNA為基礎的世界這一假說。
研究的共同通訊作者、芝加哥大學分子遺傳學和細胞生物學副教授Jonathan Staley博士說:“真核基因表達的三個重要過程,其中有兩個——剪接和翻譯現在被證實是由RNA催化。真核基因表達信號通路與其說是一條基于蛋白質的信號通路,不如說是一條基于RNA的信號通路。”
為了實現基因表達,必須將DNA翻譯為蛋白質,這些結構和功能分子催化了生命所需的化學反應。為此,儲存在DNA中的遺傳信息首先會被復制到信使RNA (mRNA)鏈中,隨后這些mRNA被用于制造蛋白質。
在真核生物中,幾乎所有的基因都進行選擇性剪接,mRNA前體按許多不同的組合進行切割再連接到一起。這顯著地增加了單個基因編碼的蛋白質數量,被認為是導致高等生物體大量復雜性的原因。剪接是一個至關重要的生物學機制——至少15%的人類疾病是由于剪接錯誤所致。
剪接體是由蛋白質和短非編碼RNA片段構成,其通過催化作用來完成剪接。在生物過程中催化作用通常被認為是以蛋白質為基礎的酶所為。然而,以往的研究則提示對之負責的有可能是剪接體中的RNA。盡管經歷了數十年的研究,到目前為止這一問題仍未獲得答案。
為了解答這一問題,Staley和芝加哥大學生物化學、分子生物學和化學教授Joseph Piccirilli,與論文的共同主要作者、研究生Sebastian Fica及Nicole Tuttle展開了合作。
研究人員首先使得剪接體喪失了自我糾正剪接錯誤的能力。隨后他們改變了剪接過程中已知被切割的mRNA前體位點上的單個原子,以及被猜測對催化作用極其重要的剪接體RNA亞基——U6上的幾個原子。其中的一些改變導致了剪接不力。他們仔細檢測并系統解救了這一功能喪失,調查了個別及組合位點。由此探究了對于剪接功能至關重要的位點,確定了U6和mRNA前體之間的聯系。
研究小組發現,U6 RNA亞基直接控制了催化功能——有效地發揮了剪接體的刀片作用。這是第一個實驗證據證明,RNA是這一關鍵生物機制的重要功能組件。
他們還發現剪接體RNAs與II型內含子(一種進化上古老的自剪接、催化RNA類型,存在于生命的所有主要分支中)在結構和功能上存在顯著的相似之處。他們認為這表明了這兩種以RNA為基礎的剪接催化因子共享了共同的進化起源,提供了進一步的證據表明,包括剪接體和核糖體在內的重要現代RNA-蛋白質復合體都從RNA世界進化而來。
Piccirilli說:“在現代生命中,蛋白質酶催化了大多數的生物反應。這一研究結果發現像剪接體這樣的,蛋白質組成多于RNA的系統利用了RNA進行催化作用,其分子祖先完全是由RNA構成,表明剪接體的反應中心有可能是來自‘RNA世界’的一個分子化石。”
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