Science醫(yī)學(xué):首個胃癌表觀遺傳圖譜
日期:2012-10-18 07:42:34
來自杜克-新加坡國大醫(yī)學(xué)研究生院的研究人員在新研究中發(fā)現(xiàn)了大量由環(huán)境因素觸發(fā)的胃癌新亞型。這項基于表觀遺傳學(xué)的新研究獲得了對胃癌復(fù)雜性的新認識,有可能促成對這一僅次于肺癌的全球第二位癌癥殺手更好的治療策略。論文發(fā)表在10月17日的《科學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》(Science Translational Medicine)雜志上。
論文的領(lǐng)導(dǎo)者、杜克-新加坡國大醫(yī)學(xué)研究生院Patrick Tan 博士說“胃癌是一種異質(zhì)性疾病,對于相同的治療患者個體常常顯示出明顯不同的反應(yīng)。改善胃癌的臨床結(jié)果需要有能夠?qū)⒒颊呒毞譃樯飳W(xué)上相似亞群的方法,從而為每個群體設(shè)計出亞型特異性治療。“
和許多的癌癥一樣,胃癌是由于遺傳突變和影響基因運作方式的外部因子所造成。這些因子就稱為表觀遺傳改變,通過甲基化來起作用。甲基化是指通過添加甲基團來修飾DNA的特異位點——CpG位點的一種化學(xué)過程。無需改變DNA序列,甲基化作用可導(dǎo)致某個基因的行為沉默。
在他們的研究中,Patrick Tan和同事們利用240個原發(fā)性腫瘤和細胞系第一全面調(diào)查了胃癌DNA甲基化圖譜。他們的目的是要鑒別出并非由主要基因突變,尤其是那些有可能用治療靶向的突變,引起的胃癌新分子亞型。
研究人員發(fā)現(xiàn)胃癌甲基化組(methylome)廣泛分布,分析的CpG位點超過一半顯示了癌癥甲基化形式改變。許多的甲基化改變與基因表達顯著改變相關(guān),表明甲基化改變有可能在胃癌形成中具有功能重要性。
研究人員還發(fā)現(xiàn)一種胃癌亞群具有極高水平的甲基化。這一CIMP亞群(CpG島甲基化表型)從前就有人提出,但對于其臨床意義仍不清楚。杜克-新加坡國大醫(yī)學(xué)研究生院研究小組證實這種CIMP亞型與預(yù)后差的年輕患者相關(guān)聯(lián)。他們還在實驗室實驗中證實這些腫瘤對去甲基化藥物的敏感性有可能增高。
Patrick Tan說:“我們的研究清晰明確地證實了這一亞群的存在和它的特征。更重要的,令我們感到受鼓舞的是測試這些CIMP腫瘤對于更有效的DNA去甲基化藥物及其他可能的表觀遺傳藥物的敏感性有可能具有潛在的功用。”
新研究還揭示了大范圍的表觀遺傳沉默區(qū)域,一些靶向廣泛區(qū)域,另一些靶向單個基因。這一發(fā)現(xiàn)有可能幫助鑒別出甲基化事件在腫瘤形成中起作用的新基因。
Patrick Tan說:“我們的結(jié)果強有力地證明了胃癌并不是一種疾病而是多種疾病的統(tǒng)稱,每種疾病都具有不同的基本生物學(xué)和標志性的特征。如果胃癌是多個相互作用因子的結(jié)果,其中包括環(huán)境因子和宿主遺傳因子,我們需要更好的途徑來診斷和治療它。”
“這些結(jié)果推動我們前進,另外的工作將側(cè)重于開發(fā)出在更早階段檢測胃癌的簡單診斷測試,以及有可能高效對抗疾病不同分子亞型的藥物和藥物靶點,”Patrick Tan說。