鞘氨醇單胞菌KC8全基因組測序完成

日期：2011-07-04 08:13:05

來自中科院城市環境研究所城市環境與健康重點實驗室，環境生物技術課題組的研究人員完成鞘氨醇單胞菌KC8（Sphingomonas strain KC8）全基因組測序，是國際上第一例雌激素降解菌的全基因組序列測定。這一研究成果在線公布在《細菌學期刊》（Journal of Bacteriology）上。

文章的通訊作者是環境生物技術課題組于昌平博士，第一作者是助理研究員胡安誼博士，這項工作得到中國科學院、科技部和廈門市資助。其中于昌平博士曾在德州農工(A&M)大學從事博士后研究工作，2009年入選中國科學院“百人計劃”。主要研究方向是環境生物技術，新興污染物去除，厭氧發酵產氫等。

雌激素是一類重要的環境內分泌干擾物（endocrine-disrupting compounds），由于環境雌激素對野生動物及人類健康有著潛在危害，研究雌激素在環境中遷移轉化及降解具有重要意義。長期研究表明，微生物降解途徑是去除環境中雌激素活性的主要方式。雖然目前已陸續有雌激素降解菌被分離培養，然而有關雌激素的微生物降解機制尤其是基因層次方面尚不清楚。鞘氨醇單胞菌KC8基因組測序的完成將為后續的功能基因分析提供重要依據。在這篇文章中，研究人員完成鞘氨醇單胞菌KC8（Sphingomonas strain KC8）全基因組測序，是國際上第一例雌激素降解菌的全基因組序列測定。

除此之外，近期還完成了一些值得關注的物質基因組測序，比如一種致病的真菌：莖基潰瘍病菌(Leptosphaeria maculans) ，這種真菌能導致十字花科蔬菜，如椰菜，卷心菜和小白菜(bok choy)，發生莖潰瘍(stem canker)，也是油菜(oilseed rape)的一個主要的威脅，其中油菜可以用來生產菜籽油(canola oil)，動物飼料和生物燃料。

另外研究人員還完成了一種金藻(golden alga)：褐潮藻(Aureococcus anophagefferens) 的基因組測定，這種藻類能導致威脅漁業和沿海海洋生物生存的褐潮(brown tide)形成，它的基因組要比其他的光合作用藻類大，有更多的基因用于光捕捉，有機碳和氮利用以及抗菌劑的合成，從而潛在性地允許它在繁盛期間接管整片海域。