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河鲀基因組大小變化研究進展

日期:2010-07-06 08:45:05

基因組大小,是指一個基因組中所擁有的DNA含量,是生物進化中最基本的、同時也是最復雜的遺傳特征之一。例如,生物的復雜度并不與基因組大小有顯著相關,即C值悖論。作為模式物種的紅旗東方鲀和斑點綠河鲀是目前已知的具有最小基因組大小的脊椎動物(<400Mb,僅相當于人基因組大小的八分之一),對它們的全基因組測序分析發現,它們卻具有與人相近的基因數目。正因為如此,河鲀基因組大小變化的研究引起關注。

在中國科學院水生生物研究所何舜平研究員的指導下,博士研究生郭寶成等通過構建刺河鲀(基因組大小為780Mb)的BAC文庫和隨機挑取克隆測序,在基因組水平對河鲀基因組大小變化進行了研究。對10個BAC克隆、長度776 kb的刺河鲀基因組測序分析發現,河鲀基因組大小變化同時表現為基因組同源區域和非同源區域長度的變化;基因組注釋結果表明,內含子長度與河鲀基因組大小變化呈正相關,刺河鲀的內含子長度為566bp,統計上顯著大于紅旗東方鲀和斑點綠河鲀的內含子長度(435bp);轉座子序列的含量和家族在不同河鲀基因組表現出明顯的不同,并且轉座子序列在不同河鲀基因組內的非等速積累是造成河鲀基因組大小變化的主要機制。

這一結果被國際同行評價為是對在河鲀基因組大小變化傳統研究的重要補充和證明。


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