在线日韩日本国产亚洲丨少妇伦子伦情品无吗丨欧美性猛交xxxx免费看蜜桃丨精品人妻系列无码一区二区三区丨亚洲精品无码不卡在线播放

Your Good Partner in Biology Research

中科院PLOS發表RNA編輯新成果

日期:2016-08-04 10:39:50

 728日,來自中科院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組、上海巴斯德研究所郝沛研究組以及密歇根州立大學王紅兵教授,在國際著名遺傳學期刊《PLOS Genetics》發表一項合作研究,題為“The Landscape of A-to-I RNA Editome Is Shaped by Both Positive and Purifying Selection”。這項研究通過對多生物物種RNA編輯事件的系統發現和分析,首次揭示了RNA編輯表觀遺傳學位點的系統進化規律,以及其在動物神經功能和神經發育中發揮的主要作用。

 

自從20年前第一次被發現以來,RNA編輯已經成為多種生命形式的遺傳編碼變異的重要來源。RNA編輯的一個突出機制是,前體mRNA分子中腺苷的去氨基。脫氨基的事件,即A-to-I編輯,將特殊的腺苷(A)轉換為肌苷(I)。在翻譯中,肌苷被解碼為鳥苷(G),從而導致密碼子的變化,往往會引起蛋白質產物中的氨基酸替換。除了遺傳再編碼,A-to-I編輯已知也影響可變剪接,修改microRNA,和改變microRNA靶位點。A-to-I RNA編輯機械的主要組成部分,是作用于RNAADAR)家族酶的所謂的腺苷脫氨酶,ADAR酶作用于底物分子內的雙鏈RNAdsRNA)。關于底物靶向和編輯活性調節的細節,還是較少的;但是,有證據表明A-to-I編輯是共轉錄的,并且ADAR靶位點傾向于某些非隨機的序列模式,并且很大程度上依賴于雙鏈RNA的三級結構。

 

A-to-I RNA編輯生成的遺傳變異,可擴展轉錄組的多樣性和復雜性,它作為一個重要的機制可幫助支持關鍵的生物學功能。由于ADAR突變而缺乏A-to-I RNA編輯的動物模型,可導致小鼠胚胎或出生后致死,或在果蠅中顯示神經缺陷。以前的研究在人類、小鼠、猴和果蠅中記錄了許多A-to-I編輯靶基因。報道的編輯靶標情況,包括神經受體、離子轉運蛋白和免疫反應受體。雖然多年來,科學家們都知道某些關鍵基因上A-to-I RNA編輯的例子,但是從進化的角度看,A-to-I編輯如何使轉錄組和蛋白質組多樣化,以及到了何種程度,還是完全沒有表征的。我們對于RNA編輯本身在進化中如何受到選擇性力量的限制,還知之甚少。關于A-to-I RNA編輯提供的適應潛能,有各種不同的觀點。

 

新一代測序技術和Model Organism ENCyclopedia Of DNA Elements (modENCODE)項目,成為模式生物的一種前所未有的資源,像果蠅和秀麗隱桿線蟲,使得我們能夠進行多基因組規模分析,以比較進化中的RNA編輯模式。

 

為了探討RNA編輯的全景以及表征進化過程中施加在A-to-I編輯上的選擇性限制,該研究小組基于modENCODE資源構建了一項研究,涉及這七種果蠅,它們有相應的參考基因組和轉錄組測序數據可用。該研究還補充了來自其他資源的數據,包括NCBI Sequence Read Archive (SRA)NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)FlyBaseFlySNPdb數據庫。

 

利用果蠅屬作為一個模型系統——其代表了大約4500萬年的進化時間,研究人員共確定了9281A-to-I RNA編輯事件。通過與前人的研究成果,以及來自果蠅組織/發育樣本或ADAR突變體的數據進行比較,并進行大規模陣列為基礎的驗證性實驗,研究人員驗證了這些事件。

 

通過系統發育分析,研究人員基于編輯位點的保守性,將A-to-I RNA編輯事件歸類為三種不同類型。第一類位點發生在單基因家族基因上;第二類發生在多基因家族基因上,但位點不保守;第三類發生在多基因家族基因上,且位點保守。對這三類位點及其基因進行選擇分析發現,第一和第二類位點均受到純化選擇(負選擇)影響,而只有第三類位點受到正選擇壓力。重要的是,發現第三類位點高度富集于神經系統的元件和功能中。通過對這三類編輯位點進行不同組織、不同發育時期以及動物變態發育過程中的分布及變化分析,第一次發現了A-to-I RNA編輯在動物發育、交配(mating)等生理過程中動態變化的證據,進一步支持了三類不同編輯位點的重要功能。這些結果都指向神經系統功能,說明了RNA編輯表觀遺傳作用的適應性主要通過神經系統功能實現。神經系統功能是檢驗有益RNA編輯位點主要標準。以上發現,揭示了由RNA編輯表觀遺傳機制引入的編碼可塑性,而產生一類新的二分變異。在二倍體有性生殖系統中,它是維持基因表達雜合性的一個重要機制,對克服等位雜合子分離有不可替代的優勢。

 


主站蜘蛛池模板: 精品人妻潮喷久久久又裸又黄| 亚洲色在线v中文字幕| 色播久久人人爽人人爽人人片av| 欧美老妇牲交videos| 日韩加勒比一本无码精品| 亚洲第一a在线观看网站| 乱人伦人妻精品一区二区| 动漫精品啪啪一区二区三区| 中国国产免费毛卡片| 77se77亚洲欧美在线| 亚洲乱码中文字幕手机在线 | 麻豆一区二区在我观看| 一区二区三区国产亚洲网站| 特黄做受又粗又长又大又硬| 国产精品55夜色66夜色| 亚洲欧美v国产一区二区| 久久激情综合狠狠爱五月| 国产女人高潮抽搐喷水视频| 亚洲乱妇老熟女爽到高潮的片| 99久久久无码国产精品秋霞网 | 亚洲国产精品va在线观看麻豆| 人妻av无码一区二区三区| 亚洲乱亚洲乱少妇无码99p| 五月丁香综合缴情六月小说| 久久久婷婷五月亚洲97色| 久久婷婷香蕉热狠狠综合| 欧美成人一区二免费视频| 18禁男女污污污午夜网站免费暖暖 | 久久国产精品精品国产色婷婷| 人妻巨大乳挤奶水hd免费看| 玩弄丰满少妇人妻视频| 久久国产精品无码一区二区三区| av无码一区二区大桥久未| 久拍国产在线观看| 国产激情一区二区三区| 妺妺窝人体色www聚色窝仙踪| 2019久久视频这里有精品15| 天码人妻一区二区三区| 国产在线精品一区二区三区不卡| 狠狠色综合网久久久久久 | 亚洲五月综合缴情在线观看|