諾獎(jiǎng)得主Science重大發(fā)現(xiàn):新型CRISPR系統(tǒng)
日期:2016-02-26 13:17:14
來(lái)自德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校、斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院和其他兩家研究機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),細(xì)菌具有一個(gè)可以識(shí)別及破壞危險(xiǎn)病毒的系統(tǒng),其利用了涉及核糖核酸(RNA)的一種新機(jī)制。它與捕獲外源DNA的CRISPR/Cas系統(tǒng)非常相似。這一研究發(fā)現(xiàn)有可能促成一些更好的方法來(lái)阻止殺死農(nóng)作物及阻礙奶酪和酸奶等乳制品生成的病毒。
這項(xiàng)研究在線發(fā)布在2月25日的《科學(xué)》(Science)雜志上。斯坦福大學(xué)病理學(xué)與遺傳學(xué)教授Andrew Fire,與德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校細(xì)胞與分子生物學(xué)研究所所長(zhǎng)lan Lambowitz是這篇論文的共同資深作者。Andrew Fire因發(fā)現(xiàn)RNA干擾而共享了2006年的諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。
RNA和DNA對(duì)于生命至關(guān)重要。在人類及許多生物體中,DNA分子是身體的藍(lán)圖,而RNA分子則是施工者——閱讀藍(lán)圖,構(gòu)建身體并維持生命功能。
研究小組第一次發(fā)現(xiàn)了細(xì)菌可以從病毒入侵者那里奪得一些RNA片段,并將這些RNA整合到自身的基因組中,利用這一信息來(lái)作為辨認(rèn)照片。在未來(lái)它們會(huì)幫助細(xì)菌識(shí)別及破壞危險(xiǎn)的病毒。
Lambowitz說(shuō):“這一機(jī)制在細(xì)菌中發(fā)揮了防御作用。你可以想象將它移植到其他生物體內(nèi),利用它來(lái)作為一種病毒探測(cè)器。”
新發(fā)現(xiàn)的機(jī)制將來(lái)自病毒的DNA和RNA辨認(rèn)照片儲(chǔ)存到了細(xì)菌的基因組中。研究人員說(shuō),從進(jìn)化的觀點(diǎn)來(lái)看這是有道理的,因?yàn)橐恍┎《臼腔?/span>DNA,而另一些則是基于RNA。
Lambowitz說(shuō),下一步研究人員可以探討如何遺傳改造諸如西紅柿一類的作物,使得它們的每個(gè)細(xì)胞攜帶上這種病毒探測(cè)器。然后研究人員可以進(jìn)行可控的實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn),改變環(huán)境條件來(lái)觀察這些改變會(huì)對(duì)病原體的傳播造成怎樣的影響。
“組合這些植物與它們面對(duì)的環(huán)境(無(wú)論是自然的或是應(yīng)用除草劑、殺蟲(chóng)劑或殺菌劑),有能促使發(fā)現(xiàn)病毒進(jìn)入到這些植物去的機(jī)制及潛在的載體是什么,”論文的共同第一作者、德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校助理研究員Georg Mohr說(shuō)。
另外就是應(yīng)用于乳制品行業(yè)中,因?yàn)椴《窘?jīng)常感染生產(chǎn)奶酪和酸奶的細(xì)菌,導(dǎo)致生產(chǎn)過(guò)程減慢或甚至阻止乳制品生成。當(dāng)前,阻止病毒感染的過(guò)程復(fù)雜且代價(jià)高昂。Lambowitz和Mohr說(shuō)可以改造乳酸菌來(lái)記錄它們的病毒互作,并抵御繼發(fā)感染。
這一基于RNA的防御機(jī)制與以往發(fā)現(xiàn)的CRISPR/Cas密切相關(guān),在CRISPR/Cas中細(xì)菌是奪取DNA片段并將它們作為辨認(rèn)照片儲(chǔ)存。這種方法已促使開(kāi)發(fā)出了一種可編輯幾乎所有活體生物基因組的新途徑,發(fā)動(dòng)了一場(chǎng)生物研究革命并引發(fā)了一場(chǎng)專利戰(zhàn),研究人員說(shuō)并不期待這一新發(fā)現(xiàn)將對(duì)基因編輯起作用。但利用這一酶機(jī)制來(lái)將一些RNA片段整合到基因組中十分地新奇,其具有潛在的生物技術(shù)應(yīng)用價(jià)值。
研究人員是在一種海洋常見(jiàn)細(xì)菌Marinomonas mediterranea中發(fā)現(xiàn)這一新防御機(jī)制的。它是一類叫做γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)的微生物的組成部分,γ-變形菌綱中包含許多的人類病原體,包括引起霍亂、鼠疫、肺感染和食物中毒的細(xì)菌。