Science重要成果:蛋白質復合物“元素周期表”
日期:2015-12-14 09:11:02
發布于12月11日《科學》(Science)雜志上的蛋白質復合物元素周期表,提供了一個新的途徑來調查蛋白質可以在自然中建立的各種各樣的結構及預測可建造的全新結構。由Wellcome Trust基因科學園和劍橋大學研究人員領導的一個跨學科小組建立的這一元素周期表,為研究進化和蛋白質工程提供了一個寶貴的工具.
幾乎所有的生物過程都依賴于蛋白質以特定的方式互作及組裝成復合物,許多疾病都與復合物組裝問題有關。目前尚未完全認識這種組裝的基本原理,但通過確定蛋白質復合物進化中的基本步驟,這一新的“元素周期表”呈現了關于蛋白質組裝的系統、有序的視圖,并為了解生物學功能提供了一個可視化工具。
Wellcome Trust基因科學園前成員、現任職于愛丁堡大學MRC人類遺傳部Joe Marsh說:“進化生成了各種各樣的蛋白質復合物。但如果分解蛋白質變為這些復合物的步驟,有一些基本原理可以解釋迄今為止人們觀察到的幾乎所有蛋白質組裝。”
可以將不同的社交舞看作是少數基本舞步的無限組合。同樣地,蛋白質復合物組裝“舞蹈”可以看做是二聚化、環化作用和亞基添加的無窮變化。由于這些是一種相當可預測的方式發生,預測出一種新蛋白質的形成方式其實并沒有你想象的那么難。
劍橋大學Cavendish實驗室物理學家Sebastian Ahnert解釋說:“我們為蛋白質復合物混亂的世界帶來了許多的秩序。蛋白質可以持續通過重復這些簡單的步驟,添加越來越多的復雜性,生成各種各樣的結構。我們基于這些基本原理進行的分類,可幫助人們理解這種復雜性。”
Sebastian說,不符合一般規律的例外情況是有趣的,這是正在開展的研究的主題。
“通過分析數以萬計通過實驗方法已確定三維結構的蛋白質復合物,我們可以看到組裝轉變中一些重復的模式,利用新的質譜數據我們開始看到更大的圖像,”Joe說。
歐洲生物信息研究所(EMBL-EBI)及Wellcome Trust Sanger研究所研究小組組長Sarah Teichmann補充說:“這項研究的核心工作是理論物理學和計算生物學,沒有牛津大學同事們來完成質譜工作做不到這一點。這是跨學科研究極其具有價值的另一個極好的例子。”
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