Nature新聞:納米孔測序儀進軍太空
日期:2015-10-15 09:49:22
科學家們在失重環境下進行實驗,首次證實掌上測序儀MinION可以在太空中使用。
Johns Hopkins大學的遺傳學家Andrew Feinberg和Lindsay Rizzardi登上了NASA的低重力飛機,在模擬的失重環境下完成了遺傳學實驗。“我非常享受這種體驗,感覺就像置身天堂,”Feinberg說。
研究人員此次測試了兩個關鍵性工具,長期保存遺傳學物質所需的移液器和便攜式納米孔測序儀MinION。MinION是英國Oxford Nanopore公司推出的小型納米孔測序儀,價格在一千美元作用,一天能生成約1Gb數據。該系統發布之后很快引起了轟動,被許多人視為基因組測序的未來。
長期保存遺傳學樣品,需要把已離心的血液轉入另一個管子。這個簡單的工作在零重力環境下卻是一大難題,因為液體很容易溢出。Feinberg和Rizzardi總共嘗試了三種移液工具,包括連著塑料管的長針(NASA提供)、標準移液器和活塞式移液器(positive displacement pipettes)。他們發現活塞式移液器的效果最好,“我們沒想到這種移液器在失重條件下這么好用,”Feinberg指出。
研究人員還測試了只有巴掌大小的測序儀MinION。這是Weill Cornell醫學院的遺傳學家Christopher Mason提議的,他想看看MinION能否在太空中工作。研究顯示,MinION能夠在失重環境下測序預先制備好的DNA樣本。Mason計劃明年將MinION送到國際空間站(ISS)去進行實驗。“這次測試的目的之一,就是看看宇航員能否在漫長的太空飛行中測序自己的DNA,”Feinberg介紹到。
Feinberg和Mason都參與了NASA的雙胞胎宇航員研究。該項目希望通過跟蹤雙胞胎宇航員Mark和Scott Kelly的生物學改變,了解人體如何應對太空中的極端環境。Scott已經登上國際空間站執行為期一年的任務,而退役了的Mark會一直呆在地球上。Scott定期將自己的生物學樣本送回地面,以便研究人員進行比較分析。這項研究將為人們解答一個重要的問題,太空旅行會對人體產生怎樣的影響。