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Nature里程碑成果:世界上最大的人類基因組變異目錄

日期:2015-10-13 08:53:30

 由千人基因組計劃協會領導的一個國際科學家小組,構建出了世界上最大的人類基因組變異目錄,可為研究人員提供有價值的線索幫助他們確立一些人容易罹患各種疾病的原因。盡管大多數的人類基因組變異都是無害的,一些甚至是有益的,但也有些變異卻可導致疾病,造成認知障礙,影響癌癥、肥胖、糖尿病、心臟病和其他疾病的易感性。了解基因組變異導致疾病的機制或可幫助臨床醫(yī)生改進診斷及治療方法及開發(fā)出新的防治對策。

 

在發(fā)表于《自然》(Nature)雜志上的兩篇研究論文中,研究人員檢測了跨越非洲、亞洲和南亞、歐洲與美洲26個種族2,504人的基因組。

 

在第一篇Nature文章中,研究人員鑒別出了人類基因組中因人而異的大約8800萬個位點,建立了一個數據庫提供給研究人員作為標準參考,確定在種群中及世界各地人類基因組組成的變異。這一目錄將人類基因組中已知變異位點增加了一倍多,現可用于廣泛的人類生物學和醫(yī)學研究中,為深入認識DNA遺傳變異促成疾病風險及藥物反應的機制奠定了基礎。

 

在鑒別出的8800多萬個變異位點中,大約1200個位點具有可能被許多種群共享的常見變異。研究顯示非洲人群具有最大的基因組多樣性,這與人類起源于非洲,并從非洲遷移至世界各地建立其他種群的事實相符。

 

國家人類基因組研究所(NHGRI)基因組變異項目主任Lisa Brooks博士說:“人類基因組中大約有8800萬個位點因人而異。其中大約四分之一的變異是常見的,存在于許多或所有種群中,而大約四分之三存在于僅1%的人群中或甚至更為罕見。千人基因組計劃為科學家們開展研究,探究疾病中的基因組貢獻,包括研究常見和罕見變異提供了一個資源。

 

在第二篇Nature論文中,科學家們調查了2,504個樣本中的基因組結構變異。他們發(fā)現了近6.9萬個結構變異。這些基因組變異,包括缺失、插入和復制,其中許多影響了基因。研究人員構建出了8類結構變異的圖譜,這些結構變異潛在地促成了疾病。

 

歐洲分子生物學實驗室基因組生物學部負責人及歐洲研究委員會研究員Jan Korbel說:“結構變異是造成人類基因組大比例DNA變異的主要原因。從來沒有研究以這樣廣泛的代表性來調查世界各地種群的基因組結構變異。”

 

Korbel和同事們發(fā)現,這些結構變異比他們原來認為的要更為復雜。例如,大多數倒位(DNA序列在基因組中改變它們的方向)常常與其他的結構改變共同發(fā)生。

 

密西根大學生物統(tǒng)計學教授、Nature研究的共同項目負責人Gonalo Abecasis說,千人基因組計劃的價值超越了數據。

 

資深作者及項目負責人Adam Auton博士說:“千人基因組計劃為其他人解答真正有意思的問題奠定了基礎。現在每個人都想知道關于人類疾病這些變異會告訴我們些什么。”

 


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