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Your Good Partner in Biology Research

Cell:看DNA玩轉溜溜球游戲

日期:2015-03-19 09:02:12

 為了讓兩米的DNA塞進微型的細胞中,細胞必須極其仔細地將遺傳信息鏈繞成染色體。令人驚訝的是,研究人員發現DNA序列使得它像溜溜球(yoyo)一樣地纏繞和解纏繞。相關研究發布在312日的《細胞》(Cell)雜志上。

 

伊利諾伊大學物理學教授、Carl R. Woese基因組生物學研究所成員Taekjip Ha說:“我們發現了這一有趣的DNA物理現象:它的序列決定了細胞內DNA包裝的柔性和穩定性。這實際上是非常基本的DNA物理現象。盡管許多人認為我們在幾十年前就應該認識到了這一DNA物理現象,但其中仍有驚喜。”

 

DNA被包裝成像串珠手鏈一樣的染色體。DNA纏繞著組蛋白形成核小體。這些核小體被編成串珠鏈,再被精致地編織成染色體。

 

科學家們早就知道DNA可以從核小體解纏繞,但他們一直猜測兩端是對稱的,即DNA解纏繞應該像是解鞋帶一樣。伊利諾伊大學的研究人員發現,DNA實際上非常不對稱,就像是纏繞著溜溜球的繩子。拉動DNA的一端只會讓纏繞變緊,而拉動另一端則會使得它像溜溜球一樣的解纏繞。

 

核小體包裝的這種物理現象是由DNA序列所決定,它使得DNA鏈足具柔性得以滿足兩個相互沖突的原理:它必須足夠穩定使得DNA密實緊湊,也必須足夠動態使得DNA鏈能夠解纏繞,被讀取而生成蛋白質。

 

Ha說:“許多的研究表明,如果你改變基因的序列,將會影響其他的東西,例如有可能生成不同的蛋白質。但卻沒有人真正地思考序列改變對于DNA物理學的影響,后者轉而引起了生物學改變。”

 

Ha的研究表明,細胞的蛋白質制造機器更容易從較易解纏繞的核小體“弱”端開始讀取。他們認為與癌癥等疾病相關的一些遺傳突變改變了核小體的穩定性。

 

“這有可能對如何讀取信息以及生成不同的蛋白造成了重大的影響。例如,有可能根據突變引起的DNA柔性和穩定性的改變差異性地生成了抗癌蛋白或是致癌蛋白,”Ha說。

 

接下來Ha打算利用下一代測序來確定整個基因組的柔性。他希望能夠構建出第一個全基因組的物理性質圖譜。他還想搞清楚一些突變是導致了DNA更容易還是更難讀取。

 


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