Nature雜志一月二十八日發表了迄今為止最全面的頭頸癌基因組測序分析結果。癌癥基因組圖譜計劃（Cancer Genome Atlas，TCGA）的科學家們揭示了人乳頭瘤病毒（HPV）和抽煙對頭頸癌的影響，比較了頭頸癌與其它癌癥的異同，為頭頸癌的診斷和治療提供了新的方向。

HPV是美國最常見的性傳播病毒之一，HPV引發的頭頸癌正在逐年增加。FDA批準的HPV疫苗能夠預防HPV感染，但病毒感染與癌癥發展之間往往存在很長的時間間隔。人們亟需理解HPV陽性頭頸癌的分子改變，并在此基礎上開發新的治療策略。

“我們揭示了HPV陽性和HPV陰性頭頸癌之間的差異，有助于反思目前對頭頸癌的處理方式。”文章的資深作者，北卡羅來納大學的副教授D. Neil Hayes說。

研究人員對279例未經治療的頭頸鱗狀細胞癌（HNSCC）進行了基因組分析，其中大多數樣本是口腔癌（61%）和喉癌（26%），約80%的樣本來自于吸煙者。

這些頭頸癌樣本只有25%與HPV感染有關。TCGA研究人員發現，HPV引起的腫瘤中存在FGFR3和PIK3CA基因突變，這些突變也出現在與抽煙有關的腫瘤中。EGFR（表皮生長因子受體）基因在HPV陰性腫瘤中頻繁突變，但在HPV陽性腫瘤中很少出現異常。這樣的信息有助于人們開發新抗癌藥物和生物學指標。

研究表明，超過70%的頭頸癌存在生長因子受體（EGFR, FGFR, IGFR, MET, ERBB2, DDR2）、信號分子（PIK3CA, HRAS）和細胞分裂調控（CCND1）基因的突變。這些基因在細胞生長和增殖中起到了重要作用，已經成為了藥物開發的靶標。

研究人員還發現了頭頸癌抵抗藥物的新線索。在與抽煙有關的頭頸癌中，癌癥耐藥性與FADD和BIRC2額外拷貝、CASP8基因突變或缺失有關，涉及了程序性細胞死亡。在與HPV有關的癌癥中，癌癥抗性與TRAF3基因缺失、E2F1基因額外拷貝有關。

這項研究將頭頸癌與其它癌癥進行了比較，揭示了癌癥發展的通用路徑，發現了潛在的治療機會。“頭頸癌的基因組與肺鱗狀細胞癌和宮頸癌很相似，這讓我們很意外。這些癌癥形成于不同的器官，但在遺傳學上卻很類似，”Dr. Hayes說。這些相似的遺傳學異常，發生在幫助細胞應對損害和壓力的通路中。

這項大規模癌癥分析有助于建立各種頭頸癌的基因組圖譜，為未來的頭頸癌研究和治療提供了重要的新線索。