病毒變了又變,華美生物N501Y,P681H突變體蛋白高效率上新發(fā)布!
日期:2021-01-12 13:51:47

踩在2020的尾巴上
國家給全國人民送來了新年禮
新冠疫苗全民免費接種
感謝為之努力的每一位先行者!
魔幻的2020將將過去
初始的2021還需警惕
畢竟,這場攻堅戰(zhàn)
還未全面勝利
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廣東從一例英國輸入確診病例中發(fā)現(xiàn)突變株
2021年1月3日最新發(fā)布,廣東省疾控中心在一名英國輸入新冠肺炎確認病例的咽拭子樣本中發(fā)現(xiàn)了B.1.1.7突變株,與近期英國報道的變異病毒基因序列高度相似。
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英國稱新冠病毒變異使傳染力高出70%,多國緊急關(guān)閉邊境
12月14日,英國首次報告了傳染性極強的新冠病毒突變株:B.1.1.7毒株,英國已將相關(guān)情況通報世界衛(wèi)生組織。
12月19日,英格蘭地區(qū)首席醫(yī)療官 Chris Whitty 表示,根據(jù)相關(guān)研究和分析,專家們認為這一變異病毒「能夠更快地傳播」。Whitty 和英國首相 Boris Johnson 稱,變種病毒株的傳染力可能較原始病毒高出 70%。
英國倫敦等地再次緊急封鎖,英國衛(wèi)生部門宣布將在英格蘭部分地區(qū)實施新冠疫情防控級別4級禁令:待在家里。而在12月20日早些時候,在英國之外,多國已宣布禁止或暫停來自英國的人員入境。包括德國、意大利、比利時、奧地利、瑞士、愛爾蘭等歐洲國家就都與英國斷航,對英國旅客限制入境舉措。
新變異毒株有什么關(guān)鍵變化?
病毒變異是常態(tài),問題是大多數(shù)情況下的變異是無足輕重,或者說對于致病性、致死率、傳染性等疫情趨勢沒有任何意義、不會產(chǎn)生影響。英國政府的新型與新發(fā)生呼吸道病毒威脅咨詢小組(Nervtag)成員Muge Cevik博士表示,迄今為止已經(jīng)觀察到新冠病毒發(fā)生過超過4000個變異,其中絕大多數(shù)毫無意義。
但這次的新變異株B.1.1.7有點不一樣。根據(jù)美國疾控中心(CDC)報道,B.1.1.7病毒株具有23個突變,包括14個非同義突變(氨基酸改變)、6個同義突變(非氨基酸改變)和3個刪除。
其中,有三個突變比較重要:
①N501Y——最令人擔(dān)憂的突變,因為它改變了刺突蛋白上最重要的部分,也就是病毒用來和人體呼吸道細胞“首次親密接觸”的受體結(jié)合域。N501Y表示刺突蛋白的第501個氨基酸從天冬酰胺的N變成了酪氨酸的Y——被認為強化了新冠病毒與人體呼吸道細胞上的ACE2受體的親和力。
②P681H表示第681位氨基酸從脯氨酸的P變?yōu)榻M氨酸的H——被認為可能影響病毒融入細胞的能力。
③69-70del表示第69-70個氨基酸被刪除——被認為可能會強化病毒逃離人體(抗體)免疫的能力,這在被大批處死的丹麥水貂身上也檢測到了。
世衛(wèi)組織:新冠病毒出現(xiàn)4種變異株
當(dāng)?shù)貢r間2020年12月31日晚,世衛(wèi)組織正式通報了新冠病毒自出現(xiàn)以來的主要變異情況,包括4種變體。
2020年1月底至2月初
新冠病毒出現(xiàn)D614G突變,到2020年6月,該變體成為全球范圍內(nèi)主要傳播的新冠病毒類型。研究表明,與初始毒株相比,該變體的感染性和傳播能力都更高,但不會引起更嚴(yán)重的疾病,也不會影響現(xiàn)有的診斷、治療、疫苗和公共衛(wèi)生措施的有效性。
2020年8月至9月
丹麥發(fā)現(xiàn)一種與水貂相關(guān)的新冠病毒變體,被丹麥相關(guān)部門命名為“Cluster 5”,具有此前未曾觀察到的變異。令人擔(dān)憂的是,該變體可能減少自然感染或接種疫苗后所產(chǎn)生的免疫保護的范圍和持續(xù)時間,相關(guān)評估仍在進行。目前丹麥僅在9月發(fā)現(xiàn)了12例人體感染此變體的病例,該變體似乎并未廣泛傳播。
2020年12月14日
英國向世衛(wèi)組織報告了一種被命名為VUI 202012/01(亦稱為B.1.1.7毒株)的新冠病毒變體。初步的流行病學(xué)研究表明,該變體具有更強的傳播力,但其導(dǎo)致的疾病嚴(yán)重程度(以住院時間和28天死亡率評估)及再感染情況并沒有變化,大多數(shù)診斷工具不受影響。截至12月30日,世衛(wèi)組織六個區(qū)域中已有五個區(qū)域的其他31個國家和地區(qū)發(fā)現(xiàn)了此種變體。
2020年12月18日
南非檢測到一種新冠病毒變體,出現(xiàn)了N501Y突變,南非將其命名為501Y.V2變體,該變體正在南非三個省中迅速傳播。盡管此前英國發(fā)現(xiàn)的變異新冠病毒也有N501Y突變,但分析表明其與南非發(fā)現(xiàn)的變異新冠病毒是不同的變體。
初步研究表明,該變體與更高的病毒載量有關(guān),可能會增加傳染性,但尚無證據(jù)表明其會引起更嚴(yán)重的疾病。還需展開進一步調(diào)查,以了解該變體對病毒傳播、診斷、疫苗等方面的影響。世衛(wèi)組織同時指出,包括新冠病毒在內(nèi)的所有病毒都會隨時間推移而變化,大多數(shù)變異不會導(dǎo)致病毒傳染性增加,有時甚至?xí)拗破鋫鞑ァkS著人與動物感染頻率的增加,病毒變異的可能性也會上升。
新變異毒株意味著什么?
在B.1.1.7譜系S蛋白的突變中,最值得注意的突變位點是RBD中的關(guān)鍵氨基酸突變N501Y,這個位點尤其重要。N501Y變異位點是新冠病毒Spike蛋白的受體結(jié)合區(qū)(RBD)關(guān)鍵位點之一。Spike蛋白(即棘突蛋白,S蛋白)是新冠病毒包膜上主要的受體結(jié)合蛋白,是它入侵人體細胞的關(guān)鍵“鑰匙”。而人體細胞上的受體“血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2(ACE2)”就像一個“鎖”,病毒上的S蛋白則相當(dāng)于“鑰匙”。病毒的S蛋白與細胞上的ACE2受體結(jié)合,從而打開感染人體細胞的大門。因此,發(fā)生在S蛋白受體結(jié)合區(qū)域(RBD)的變異可能增強病毒的傳染性和致病性,也可能引起針對疫苗的免疫逃逸,特別值得關(guān)注。今年7月30日,中國科學(xué)家周育森等人發(fā)表在 Science 的研究表明,新冠病毒適應(yīng)和感染野生型小鼠,正是因為有了這個 N501Y突變。該突變大大增加了RBD與受體ACE2的親和力,從而增強新冠病毒對小鼠的感染性。
S蛋白中的P681H突變可能也對病毒特征有潛在影響,這一位點緊鄰S蛋白的S1/S2 Furin裂解位點,F(xiàn)urin裂解位點對新冠病毒感染宿主細胞至關(guān)重要,所以推測P681H對新冠病毒的感染性也可能有所影響,但目前還沒有明確的實驗證據(jù)。此外,S蛋白中的其他突變位點推測對功能影響不大,尚未引起關(guān)注。
在此前已經(jīng)發(fā)現(xiàn),D614G變異株新冠病毒可以增強S蛋白與人體細胞ACE2受體的結(jié)合力,從而大大增加新冠病毒的傳染性。目前,分子流行病學(xué)抽樣調(diào)研發(fā)現(xiàn),D614G變異株已經(jīng)占到全球新冠病毒發(fā)病的70%以上,成為最主要的新冠流行毒株。幸運的是,D614G變異株并沒有顯著增強病毒的致病力,而且該毒株也在目前批準(zhǔn)上市和應(yīng)急接種的疫苗保護之下。新冠病毒不斷的變異為疫苗和抗體藥物的研發(fā)提出了嚴(yán)重的挑戰(zhàn)。
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