最新生物學信息圖表標準發布
日期:2010-09-21 13:30:27
標準化的圖表,做為一種視覺語言,被廣泛應用于多個學科領域。使用標準圖表法傳達復雜信息,表意清晰、易于理解。但在圖表信息占據重要地位的生物學領域,卻一直沒有統一的標準圖表描述所有的生物化學反應、路徑和網絡。
2005年,各國的研究人員開始努力開發一種專門用于分子和系統生物學研究的新圖表標準,即SBGN項目。該項目由日本東京系統生物學研究所的北野宏明發起,英國辛克斯頓歐洲生物信息學研究所的尼古拉斯·勒·諾瓦克和美國加州理工學院的邁克爾·胡克負責協調。研究團隊則包括生物化學家、模型制作人員和計算機科學家。
勒·諾瓦克指出,在基因組學時代,特別是高通量技術出現之后,生物學數據的規模總量有了大幅度增長,SBGN會使研究人員更容易了解彼此的模型,更有效地分享數據。它將使眾多的系統生物學家從中受益,無論他們研究的重點是生化進程中的哪個環節。
為了確保新圖表不會變得過于龐大、復雜,研究人員定義了三種不同類型的圖解,互相補充,描述分子過程、實體關系和生化活動中的各個環節。報道稱,SBGN十分簡單,有眾多研究團體的廣泛參與,相信這種表示法將會迅速得到廣泛的應用。
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