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科學家開發出高效新型遺傳篩選技術

日期:2014-04-22 09:09:44

 

探索基因及其表達的蛋白在特定生理、病理、發育等過程中所起的作用一直是生命科學領域研究的重要內容。盡管利用RNA干擾鑒定高等生物基因功能的技術已經普及,但是這種方法經常伴隨脫靶現象;而且由于只能部分抑制基因表達,往往不足以造成表型變化從而影響對其基因型的判斷。近幾年基因編輯技術的出現,使得對單一基因進行修飾的遺傳手段得到迅速發展,然而在哺乳細胞內基于基因完全敲除進行大規模功能性篩選的方法依然空缺。

 

生命科學學院魏文勝課題組為此開發了一種基于CRISPR/Cas9系統的慢病毒聚焦型人源細胞文庫、功能性基因篩選平臺以及基于高通量深度測序技術解析數據的完整技術路線。利用這一高效的新型遺傳篩選技術,成功鑒定出對兩種細菌毒素侵染宿主所必需的宿主受體、以及多種新型蛋白位點。這一強大的高通量基因篩選技術的建立不僅能夠幫助人們研究與病菌侵染相關的宿主蛋白及通路,還可以惠及眾多生物醫學相關領域的研究。這項具有里程碑意義的工作是在激烈的國際競爭中完成,與已經在《科學》雜志發表的兩篇主題相近的文章比較,該工作所報道的方法具有更為廣泛的細胞系適應性,對于功能性基因的篩選和鑒定具有十分重要的意義。

 

該項研究成果是與北京大學生物動態光學成像中心 (BIOPIC) 黃巖誼課題組合作完成的,49日在線發表于《自然》雜志 (High-throughput Screening of a CRISPR/Cas9 Library for Functional Genomics in Human Cells)。其共同第一作者為北京大學生命科學學院魏文勝課題組的博士研究生周悅欣、朱詩優和蔡昌祖。研究課題得到了國家重點基礎研究發展計劃、國家自然科學基金和北大清華生命科學聯合中心的支持。

 


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