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Nature新文章:解碼姥鯊基因組

日期:2014-01-10 09:05:29

 

一個國際研究人員小組對姥鯊(elephant shark)的基因組進行了測序和分析。將其與人類和其他脊椎動物的基因組進行比較,揭示出了為何鯊魚的骨架主要是由軟骨構成,而不像人類的骨架一樣是由骨骼構成,以及鯊魚的免疫系統相比人類要簡單得多的原因。Byrappa Venkatesh和他的同事們將這些研究結果發表在最新一期的《自然》(Nature)雜志上。

 

通過對免疫系統進行分析,研究人員意外地發現鯊魚似乎沒有稱之為輔助性T淋巴細胞T-helper lymphocyte)的特殊細胞類型,直到現在人們都認為在脊椎動物中輔助性T淋巴細胞對抵御病毒/細菌感染及預防糖尿病和風濕性關節炎等自身免疫反應起至關重要的作用。

 

盡管鯊魚免疫系統的構造看似原始,但它卻顯示強大的免疫防御能力且長壽。論文的共同作者、德國馬克思普朗克免疫生物學和表觀遺傳學研究所所長Thomas Boehm說:“姥鯊免疫系統的結構與哺乳動物有很大的不同。很明顯,沒有這種特殊的細胞類型鯊魚也能夠有效地應對各種類型的感染。這表明,自然可以為同樣的問題提供不同的解決方案。”

 

當艾滋病患者體內的輔助性T細胞遭到破壞時,他們會死于病毒和細菌感染。直到現在,人們都認為這些細胞對于免疫系統至關重要。新研究結果挑戰了人們長期以來的認知,為開發出非直觀的策略來調節人類免疫功能開啟了一條從所未有的途徑。

 

研究人員還調查了包括姥鯊在內的軟骨魚類不能夠像人類和其他的硬骨脊椎動物一樣用骨骼來替代軟骨的原因。基因組分析結果闡明了鯊魚缺少存在于所有硬骨脊椎動物中的一個基因家族,這一基因家族對于骨骼形成至關重要。當研究人員在斑馬魚一類的硬骨魚中失活這些基因時,發現不會發生鈣化。這一研究結果強有力地表明了,所研究的這一基因家族有可能是更好地了解諸如骨質疏松癥等骨疾病的一個起點。

 

此外,研究還揭示了姥鯊基因組是所有脊椎動物中進化最慢的基因組。姥鯊甚至打敗了近期研究證實進化極其緩慢的、被稱之為“活化石”的腔棘魚。因此,姥鯊有可能是很久以前滅絕的所有有頜脊椎動物祖先的最佳代表。

 

包括鯊魚、鰩魚和銀鮫在內的軟骨魚類,是現存最古老的有頜脊椎動物群,其是在大約4.5億前與硬骨脊椎動物分歧開來。姥鯊是一種棲息在沿澳大利亞南部和新西蘭的大陸架,水深為200-500米的溫帶水域。在大約1000個軟骨魚類物種中,選擇姥鯊作為模型是因為它的基因組相對緊湊,只有人類基因組的三分之一大小。

 


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