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表觀遺傳學(xué)變異或可解釋慢性腎病

日期:2013-11-27 09:00:23

由賓夕法尼亞大學(xué)佩雷爾曼醫(yī)學(xué)院腎電解質(zhì)和高血壓部門的醫(yī)學(xué)副教授、臨床科學(xué)家Katalin Susztak博士帶領(lǐng)的一項(xiàng)研究,試圖闡明慢性腎病的分子根源和遺傳素質(zhì),其研究成果發(fā)表在最近的Genome Biology雜志上。

 

在這項(xiàng)研究中,Susztak和她的共同通訊作者、來自阿爾伯特愛因斯坦醫(yī)學(xué)院的John Greally發(fā)現(xiàn),在一項(xiàng)全基因組調(diào)查中,DNA化學(xué)修飾模式的顯著差異,會影響慢性腎病患者和健康對照者的腎臟細(xì)胞內(nèi)的基因表達(dá)。這項(xiàng)研究首次表明,這些修飾——表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域的基石——的改變也許可以解釋慢性腎病。

 

表觀遺傳學(xué)是基因活性如何在DNA序列不發(fā)生實(shí)際變動的情況下而被改變的一門科學(xué)。DNA能通過不同的化學(xué)基團(tuán)被修飾。就本研究來說,這些化學(xué)基團(tuán)是甲基原子團(tuán),就像使用便利貼作為提醒一樣,打開或關(guān)閉基因組的區(qū)域,能夠使這些區(qū)域或多或少地作為一個基因被“閱讀”。

 

慢性腎病是一種疾病,以腎臟纖維化和腎功能的逐漸衰竭為特征,腎臟被損傷,不能充分地過濾血液。損傷能引起體內(nèi)廢料的堆積,從而導(dǎo)致其他健康問題,包括心血管疾病、貧血和骨病。根據(jù)疾病控制中心的數(shù)據(jù),在美國有超過10%的人(或者2千萬以上)在20歲或者更大年齡患有慢性腎病。

 

過去的流行病學(xué)研究表明,不利的宮內(nèi)環(huán)境和出生后環(huán)境,對慢性腎病的發(fā)展具有一個長期的、一生的作用。不利的宮內(nèi)因素包括缺乏營養(yǎng)引起的的小于胎齡兒,相反地,大于胎齡兒,例如如果胎兒母親具有妊娠期糖尿病。

 

來自糖尿病控制和并發(fā)癥試驗(yàn)的研究也表明,糖尿病患者如果在25年前糖尿病控制不佳,那么盡管他們接受一個十年的血糖良好控制,其仍然具有腎病的增加性風(fēng)險。Susztak說:“這被稱為代謝記憶效應(yīng),腎臟細(xì)胞能記住過去的壞的代謝環(huán)境。”

 

兩種細(xì)胞類型的比較

 

Susztak的實(shí)驗(yàn)室利用在顯微鏡下看上去近乎相同的人腎臟細(xì)胞,但是每種細(xì)胞類型受甲基原子團(tuán)影響的途徑迥然不同。一般來說,一個基因上甲基原子團(tuán)數(shù)量的增加會打開表達(dá),甲基原子團(tuán)數(shù)量的減少會關(guān)閉一個基因的表達(dá)。

 

特別地是,他們發(fā)現(xiàn)甲基原子團(tuán)的差異,不是位于患病腎臟細(xì)胞上的啟動區(qū),而是大部分位于增強(qiáng)子區(qū),也靠近重要腎臟轉(zhuǎn)錄因子的序列。Susztak說:“這都說明了這些區(qū)域在調(diào)控基因表達(dá)中的重要性。”

 

啟動子區(qū)在基因前面,靠近他們影響的基因。增強(qiáng)子區(qū)則離影響基因的位置更遠(yuǎn)。這個差異表明,兩種細(xì)胞類型能夠?qū)毫Ξa(chǎn)生不同的應(yīng)答。

 

Susztak說:“基因組中,核心腎臟發(fā)育部位的腎臟纖維化——基因編碼膠原蛋白和生長因子——相關(guān)的甲基化的差異,表明這些差異在一個人的發(fā)育早期就建立起來,因?yàn)榛?/SPAN>PaxPax8在胎兒的發(fā)育腎臟中是活躍的。”

 

Susztak說:“迄今為止,大多數(shù)腎臟表觀學(xué)研究,都針對腎臟癌癥細(xì)胞的啟動區(qū)。我們在兩個細(xì)胞群間的調(diào)節(jié)異常中發(fā)現(xiàn)的差異也許表明,癌癥中的調(diào)節(jié)異常與慢性腎病中的調(diào)節(jié)異常有所不同。5年前,還沒有癌癥以外的表觀遺傳學(xué)信息。”

 

總的說來,這項(xiàng)研究成果表明,表觀遺傳學(xué)標(biāo)記的調(diào)節(jié)異常,通過影響那些導(dǎo)致更多纖維化的通路,在慢性腎病中發(fā)揮作用。鑒定與這個出錯系統(tǒng)相關(guān)的基因和蛋白,也許可以幫助我們鑒定新的生物標(biāo)記物和新的藥物靶點(diǎn)。

 

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