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《Cell》:lncRNAs開辟增強(qiáng)子生物學(xué)新時(shí)代

日期:2013-09-22 09:16:12

長鏈非編碼RNAslong noncoding RNAs LncRNAs)是在真核生物中發(fā)現(xiàn)的一類長度大于200個(gè)核苷酸、沒有長閱讀框架、但往往具有mRNA結(jié)構(gòu)特征的RNALncRNAs在基因組中存在普遍的轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象,但較之編碼蛋白質(zhì)的基因,往往表達(dá)水平比較低。LncRNAs自身的表達(dá)水平也受到轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制的嚴(yán)密調(diào)節(jié)。

 

由于LncRNAs不編碼蛋白質(zhì),曾一度被認(rèn)為是轉(zhuǎn)錄本的“噪音”,不具備生物學(xué)功能。然而,近幾年來科學(xué)家們的研究發(fā)現(xiàn),LncRNAs參與調(diào)節(jié)了多種重要的細(xì)胞活動(dòng),如基因表達(dá)、招募染色質(zhì)修飾物、調(diào)節(jié)X染色體失活(XIST)、基因組印記、蛋白質(zhì)折疊和蛋白質(zhì)活性等。并且一旦異常表達(dá)則可能導(dǎo)致體內(nèi)生物學(xué)功能紊亂,進(jìn)而引發(fā)包括癌癥在內(nèi)的各種疾病。

 

有新的研究報(bào)告稱發(fā)現(xiàn)一些LncRNAs增強(qiáng)子區(qū)域相關(guān),并且這樣的非編碼轉(zhuǎn)錄與鄰近基因活性增高有關(guān)聯(lián)。還有一些實(shí)驗(yàn)表明,增強(qiáng)子的功能可以通過一種轉(zhuǎn)錄的LncRNAs介導(dǎo),這有可能是LncRNAs的一種常見功能。增強(qiáng)子相關(guān)的LncRNAs可以遠(yuǎn)距離及跨染色體發(fā)揮作用激活遠(yuǎn)端啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄。

 

912日的《細(xì)胞》(Cell)雜志上,來自馬克斯-普朗克分子遺傳學(xué)研究所的Ulf Andersson ØromWistar研究所的Ramin Shiekhattar以“Long Noncoding RNAs Usher In a New Era in the Biology of Enhancers”為題,綜述了在了解LncRNAs表達(dá)作用,以及這些RNAs通過結(jié)合蛋白質(zhì)因子及調(diào)節(jié)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)參與增強(qiáng)子功能等方面取得的一些最新的進(jìn)展。

 

作者在文中寫到,發(fā)現(xiàn)具有激活功能的LncRNAs以及它們與遠(yuǎn)端調(diào)控元件(增強(qiáng)子)之間的密切關(guān)聯(lián),對于我們了解分化、發(fā)育和疾病進(jìn)程中基因的調(diào)控具有深遠(yuǎn)的意義。在過去的20年里,科學(xué)家們一直通過描述蛋白質(zhì)編碼基因的表達(dá)改變來分析健康組織中及疾病狀態(tài)下的基因表達(dá)程序。認(rèn)識到組織及時(shí)間特異性的基因表達(dá)調(diào)控受到增強(qiáng)子處表達(dá)的LncRNAs的控制,為我們提供了一個(gè)機(jī)會(huì)分析另外一些重要的調(diào)控分子,有可能讓我們更深入地了解疾病發(fā)生及發(fā)展過程中位點(diǎn)特異性的基因調(diào)控。

 

盡管近期的一些實(shí)驗(yàn)闡明了這類LncRNAs發(fā)揮功能的一些機(jī)制,人們對于激活功能所需LncRNA密碼的了解仍處于初期階段。了解支配增強(qiáng)子功能的LncRNA序列決定簇(sequence determinant)或是結(jié)構(gòu)條件將為我們帶來豐富的信息。此外,確定RNAs激活功能的等位基因特異性也極其的重要。盡管多個(gè)研究指出了一些激活RNAs的順式介導(dǎo)功能,然而這種激活是僅限于單等位基因或是能夠擴(kuò)展至雙等位基因該問題尚未得到解決,這一重要的問題或許能夠揭示激活LncRNAs在劑量補(bǔ)償中所起的廣泛及重要功能。

 

最后研究人員指出:“由于RNA是蛋白質(zhì)的進(jìn)化前體,LncRNA介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控也許是在蛋白質(zhì)出現(xiàn)之前調(diào)控基因表達(dá)的一種古老機(jī)制。隨著我們繼續(xù)不斷地累積對于這些調(diào)控RNAs的認(rèn)識,越來越明顯的是,一些新的及未曾預(yù)料到的組織和時(shí)間特異性表達(dá)調(diào)控層面有待被發(fā)現(xiàn)。”

 


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