Nature:最大規(guī)模人類疾病測(cè)序研究
日期:2013-05-24 09:07:22
來自倫敦大學(xué)瑪麗女王學(xué)院的研究人員領(lǐng)導(dǎo)完成了迄今為止最大規(guī)模的人類疾病測(cè)序研究,調(diào)查了6種自身免疫疾病的遺傳基礎(chǔ)。研究結(jié)果發(fā)表在5月22日的《自然》(Nature)雜志上。
這6種疾病分別是自身免疫性甲狀腺病、乳糜瀉、克羅恩病、銀屑病、多發(fā)性硬化癥和1型糖尿病,目前對(duì)于這些疾病的確切病因并不清楚,人們認(rèn)為是遺傳和環(huán)境因素的復(fù)雜組合作用所導(dǎo)致。已經(jīng)鑒別的遺傳變異只能解釋每種疾病部分的異質(zhì)性。到目前為止,所采用的技術(shù)通常鑒別出的都是只具微弱效應(yīng)的群體常見變異。
在這項(xiàng)研究中,來自全球的科學(xué)家組成的一個(gè)研究小組利用高通量測(cè)序技術(shù),力圖在一個(gè)包括近42,000名個(gè)體(24,892名自身免疫性疾病患者和17,019名對(duì)照)的樣本中,鑒別出從前確認(rèn)的25個(gè)風(fēng)險(xiǎn)基因的新變異,其中包括罕見變異和潛在高風(fēng)險(xiǎn)變異。
在一項(xiàng)“罕見變異綜合性全基因組關(guān)聯(lián)假說”中,人們提出風(fēng)險(xiǎn)基因中少量的罕見變異有可能是這些疾病異質(zhì)性的主要原因。
然而,Nature新研究表明,這些疾病的遺傳風(fēng)險(xiǎn)更有可能,與在群體中數(shù)百個(gè)常見的微弱效應(yīng)變異的復(fù)雜組合有關(guān)。
作者估計(jì),對(duì)于可通過常見變異進(jìn)行解釋的疾病,這些風(fēng)險(xiǎn)基因中的罕見變異只大約導(dǎo)致了3%的異質(zhì)性。
該研究的領(lǐng)導(dǎo)者、倫敦大學(xué)瑪麗女王學(xué)院胃腸道遺傳學(xué)教授David van Heel說:“研究結(jié)果表明,這些自身免疫性疾病的風(fēng)險(xiǎn)并不歸因于少數(shù)的高風(fēng)險(xiǎn)遺傳變異,而是具有微弱效應(yīng)的許多常見遺傳變異隨機(jī)選擇所導(dǎo)致。”
“在每一種疾病中都有可能存在成百上千這樣的變異,遺傳風(fēng)險(xiǎn)有可能來自于遺傳自父母雙親的大量的這些變異。如果情況確是這樣的話,我們或許永遠(yuǎn)也不可能準(zhǔn)確預(yù)測(cè)個(gè)體罹患這些常見自身免疫性疾病的遺傳風(fēng)險(xiǎn)。不過新研究結(jié)果為我們提供了有關(guān)這些疾病的生物學(xué)基礎(chǔ)和相關(guān)信號(hào)通路的重要信息,有可能促使發(fā)現(xiàn)新的藥物靶點(diǎn)。
該研究利用高通量測(cè)序技術(shù),第一次證明了測(cè)序可以與基因分型芯片平臺(tái)一樣準(zhǔn)確,可作為“金標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)”用于基因分型。
論文的共同作者、Barts與倫敦醫(yī)學(xué)和牙醫(yī)學(xué)院副校長(zhǎng)Richard Trembath說:“研究結(jié)果提示需對(duì)決定常見自身免疫性疾病形成風(fēng)險(xiǎn)的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行重新評(píng)估,并將推動(dòng)未來仔細(xì)評(píng)估除已知賦予了這些重要醫(yī)學(xué)疾病敏感性的區(qū)域之外的人類基因組區(qū)域。”