這個方法發現于2012年，是加州大學霍華德-休斯醫學研究中心的Jennifer Doudna和Martin Jinek與瑞典分子感染醫學實驗室的Emmanuelle Charpentier共同研究的結果。最初它被用于菌細胞的基因編輯，但是現在已經在人類DNA上進行了測試。

Doudna說道：“修改生物體基因特定部分的能力對于增加我們對生物體的認知是必不可少的。這是該領域的一種巨大跨越，因為它意味著基本上任何人都能夠使用這種基因編輯或者重新編寫的技術帶給哺乳動物基因變化。”

這種編輯方法使用了一種RNA酶復合體，Cas9，這種物質目前存在于一些能夠通過基因編輯實現自我保護的細菌中。這種細菌能夠切除病毒DNA鏈接，并且使它們成為擁有自己DNA一個整體。它們隨后就能夠以RNA的形式形成有效的遺傳物質副本。

Doudna解釋道：“與過去數十年里進行基因工程的其它任何方法相比，這種方法的優點在于它使用的是單一的酶。這種酶不需要改變你設定目標的每一個點，你只需要使用一個不同的RNA副本對它進行重新編輯，這很容易設計和實現。”