在线日韩日本国产亚洲丨少妇伦子伦情品无吗丨欧美性猛交xxxx免费看蜜桃丨精品人妻系列无码一区二区三区丨亚洲精品无码不卡在线播放

Your Good Partner in Biology Research

中國基因組測序成果登Nature子刊

日期:2012-05-15 08:16:55

來自深圳華大基因研究院,張家口市農業科學院,丹麥哥本哈根大學的研究人員發表了題為“Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential”的文章,最新完成了一種植物:谷子(foxtail millet,學名Setaria italica)的全基因組測序,谷是目前種植第二廣泛的粟類物種,這項研究為提高谷類糧食遺傳性狀提供了寶貴的資源。相關成果公布在513Nature Biotechnology雜志上,目前這一論文免費開放。

 

文章的通訊作者分別是深圳華大基因的汪建和王俊兩位研究員,以及張家口市農業科學院的趙治海研究員。第一作者為華大基因研究院副院長張耕耘研究員等人,張耕耘表示,“這一全基因組序列的解析,是揭示作物遺傳調控奧秘的關鍵步驟,也是生物學研究和育種的一個重要平臺。”

 

谷子基因組

 

谷子又稱為粟,去殼后稱為小米。谷子起源于我國,已有7000年栽培歷史,是傳統的優勢作物、主食作物、抗旱耐瘠作物,在中華悠久的文明史上發揮了重要作用。然而,谷子的主產區多為干旱少雨的貧困地區,產量低一直是困擾谷子生產的最大難題。在一些山區、半山區只能以種谷為生的農民們,祖祖輩輩種著畝產不足70公斤的谷子,苦苦地掙扎在貧困線上。

 

“傳統品種的低產量極大的限制了谷子的種植和利用”,張耕耘說,“張家口市農業科學院的趙治海研究員近年來培育出了雜家品種,將谷子的產量提高了一倍。我希望這項研究成果能作為一個范例——應用基因組序列,更好的理解,更快的培育出之前被忽視的農作物,具有更高產量的,質量更好,耐受性更強的新品種。”

 

在這項研究中,研究人員利用新一代測序技術,對一種國內北部谷子品系:張谷(Zhang gu)進行了從頭測序(de novo assembly),獲得了大小約為423MbN50達到了1.0Mb),包含38,801個蛋白編碼基因的全基因組序列,這些基因預測超過81%已經表達。通過基因組注釋和分析發現,谷子基因組中的重復序列約占整個基因組的46%

 

除此之外,研究人員還對另一谷子品系A2進行了重測序——A2是一種廣泛使用的谷子雜交雌株品系,利用這兩個品系親本F2代群體,完成了高密度遺傳連鎖圖譜。

 

基因組數據分析比對

 

通過將谷子基因組與水稻基因組進行比對,研究人員發現了谷子染色體的進化規律和變化趨勢,這對于了解這一農作物的進化具有重要意義。“我們發現九種谷子染色體是在三個染色體重組事件后形成的”,張耕耘說,“這三個事件,其中兩個出現在谷子從水稻分化之后,接下來在谷子從高粱分化之后,又出現了一次染色體重排。”

 

相比于C3植物(如水稻和小麥),C4植物具有更高的水分利用效率和光合效率,以及抗旱能力。谷子就是一種二倍體C4植物,利用其基因組序列數據,研究人員能更全面的分析C4光合作用途徑的幾種關鍵基因,結果他們發現在C4碳固定途徑中出現的基因,也出現在了C3植物中,因此研究人員推測C4途徑可能是由于調控表達的差異所引起的功能上的改變導致的。

 

谷子基因組序列的繪制完成,有利于分析作物數量性狀位點,在這項研究中,研究人員就利用谷子基因組幫助鑒定了抗除草劑基因,并且精確識別出了抗稀禾定性狀相關的基因,印證了之前研究表明的一個單核苷酸突變位點(SNP)可能是導致植株對稀禾定敏感性發生改變的結論。

 

測序方法

 

這項研究采用了全基因組鳥槍法-新一代測序方法,來組裝繪制這一基因組圖譜。測序采用的是Illumina第二代測序儀(Illumina Genome Analyzer II以及HiSeq 2000,分別負責短插入片段文庫和長插入片段文庫 ),數據過濾后,研究人員將約40Gb的數據呈遞給SOAPdenovo

 


主站蜘蛛池模板: 久久久国产乱子伦精品| 国产人妻777人伦精品hd| 好吊色欧美一区二区三区四区| 成人毛片100部免费看| 亚洲日韩av一区二区三区四区| 日本人妻伦在线中文字幕| 亚洲国产成人久久综合人| 欧美性色大片在线观看| 久久精品国产只有精品2020| 免费无码专区在线视频| 蜜臀av在线观看| 日日橹狠狠爱欧美超碰| 色悠久久久久综合欧美99| 国产免费人成在线视频网站| 56pao国产成视频永久| 天天躁人人躁人人躁狂躁| 国产精品一久久香蕉国产线看观看| 免费国产黄网站在线观看动图| 玩弄放荡人妇系列av在线网站| 国产亚洲欧美日韩精品一区二区| 午夜毛片不卡高清免费看| 乱人伦中文字幕成人网站在线| 久久婷婷激情综合色综合俺也去| 国产欧美在线一区二区三| 毛片大全真人在线| 丰满熟妇乱子伦| 国产一区二区三区乱码在线观看| 亚无码乱人伦一区二区| 久久视频这里只精品99| 再深点灬舒服灬太大了在线视频| 国产3p露脸普通话对白| 国产亚洲精品久久久久久无几年桃| 狠狠色噜噜狠狠狠狠av不卡| 国产激情无码一区二区app| 亚洲人成黄网站69影院| 毛片内射久久久一区| 欧美性插b在线视频网站| 正在播放东北夫妻内射| 日日摸日日碰夜夜爽无码| 国产免费一区二区三区在线观看| 国产日韩欧美|