癌基因組測序證實Nature前文結論
日期:2012-05-11 08:40:11
一直以來,科學家們都認為皮膚癌中最致命和最具威脅性的一類癌癥與太陽光有關,2010年一個研究小組在Nature雜志上公布了肺癌與皮膚癌的癌癥基因組,指出患有其中皮膚癌的患者由于受到了光照的影響,因而基因組發生了癌變。這說明皮膚癌實際上是可以預防的。今天(5月10)公布的另外一篇Nature文章又再次證明了這一觀點,證實了慢性光照在其中扮演的重要角色,從而揭示了腫瘤形成新型遺傳變化。
這種皮膚癌就是黑色素瘤,這是一種惡性程度極高的皮膚惡性腫瘤,病程進展迅速。黑色素瘤的發病率隨人種、地域、種族的不同而存有所差異,白種人的發病率遠高于黑種人高,我國雖屬黑色素瘤的低發區,但進入21世紀后發病率卻呈不斷上升趨勢。
黑色素瘤基因突變與重排
在這篇文章中,研究人員通過對25位患有該種疾病的患者樣品進行測序分析,首次進行了黑色素瘤高分辨率分析。文章通訊作者之一,Broad研究院資深研究員Lynda Chin說,“人類黑色素瘤全基因組分析首次表明,在這種癌癥類型中存在如此多的結構重排”,Chin教授之前在Dana-Farber研究院工作,目前已進入德州大學MD Anderson癌癥中心,擔任基因組醫學部主任。
與預期的一樣,研究人員在25個腫瘤樣品的24個中發現了已知的BRAF和NRAS突變,這兩個基因都是細胞生長過程中的重要信號分子。
還有另外一個突變也備受關注,那就是PREX2突變,這個突變出現在基因中斷(genetic disruption)的一個交聯處,此處基因中斷可能可促進腫瘤生長。這些突變并不只是在通常開啟致癌基因的熱點處出現,也散布在這一基因片段各處,并且常常以另外一種癌癥相關基因:抑癌基因被關閉的形式出現。
“這種突變模式看上去更像抑癌基因,但是從功能實驗中,我們發現這更有可能是一個致癌基因”,文章的第一作者Michael F. Berger說。當PREX2正常工作的時候,它能與PTEN蛋白相互作用,后者正是一個抑癌因子。Chin教授原Dana-Farber實驗室的小鼠實驗證明,PREX2突變可以促進腫瘤以一種目前還并不十分了解的方式擴增。
證實之前的研究
除此之外,研究人員還證實了一些早期的發現,2010年科學家們分析了肺癌與皮膚癌的癌癥基因組,發現黑素瘤患者的基因組有33,345個明顯突變,肺癌患者的基因組有22,910個明顯突變。這些突變并不均勻地分散在基因組上,而是集中出現在基因編碼區域外圍。
這項研究表明可通過追蹤這些變異來測定致癌因素對癌癥發生的影響程度大小。而這些針對致癌因素的追蹤研究發現,其實皮膚癌和肺癌是可以預防的。
在這項研究中,研究人員也發現機體并未常受到光照的腫瘤出現區域中,每百萬個堿基對中會出現3-14個突變,而經常進行高光照的病患樣品,則每百萬個堿基對中會出現111個突變。
在未常受到光照的機體區域腫瘤中出現了曬傷痕跡——比如腳底——證明了光照在黑色素瘤發生過程中的作用,美國非盈利黑色素瘤聯盟科學項目部主任Laura Brockway-Lunardi說。
“黑色素瘤的發病率越來越高,尤其是在年輕女性當中,這可以歸咎于光照以及室內照射”,Brockway-Lunardi說。
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