近日來自華盛頓大學醫學院的科學家們利用強大的DNA測序技術不僅確定了一位癌癥患者的根源基因突變——被視為是個體化癌癥治療的關鍵，并且繪制了疾病的基因演變圖譜，監控了對于治療的反應。

上接：DNA測序為個體化癌癥治療奠定基礎（上）

利用基因組研究所開發的一項稱為“深度數字測序”（ deep digital sequencing）的技術，她們對患者腫瘤樣品中的個別突變進行了超過1000次的測序。從而提供了每位患者腫瘤基因組每種突變頻率的讀值，研究人員基于此繪制出了隨病情進展癌細胞的遺傳進化圖譜。

他們發現隨著癌癥發展，腫瘤獲得了一些新突變，然而卻始終保留著一些初始的突變群，它們在細胞致癌作用中占據首要地位。這些研究發現表明如果能針對癌癥早期發生的遺傳變異，癌癥靶向藥物或可能更有效。而靶向僅存在于后期演變癌細胞中突變的藥物則有可能不會對疾病產生太大的效應，因為它們無法殺死所有的腫瘤細胞。

Mardis認為測序癌細胞的完整基因組對拼湊癌細胞進化方式精確圖像而言是必不可少的。如果研究人員僅對涉及基因的小部分基因組測序，那他們就不具備隨時間追蹤突變頻率的統計能力（僅有1-2%的基因組包含基因）。

在另一項對絕經后雌激素受體陽性乳腺癌婦女的III期臨床試驗研究中，華盛頓大學的研究人員證實測序可以幫助預測哪些婦女將對芳香酶抑制劑治療產生反應。在手術前這些患者通常被給予降低雌激素的藥物。然而卻只有一半的雌激素受體陽性乳腺癌婦女對這些藥物產生反應，醫生無法預測哪些患者將從中受益。

有趣的是，通過對芳香酶抑制劑治療前后的患者乳腺腫瘤進行測序，研究人員發現在反應患者體內發生了實質性的基因組變化，而無應答患者的基因組則并未通過治療發生顯著的改變。

“從未有人以這種分辨率水平來觀測治療反應。誰正對治療產生應答一目了然，”Mardis說。

此外，研究人員還在靶向缺陷蛋白的小分子抑制劑藥物對應的乳腺腫瘤中鑒別出了一系列的突變。這些研究結果表明對于芳香酶抑制劑無應答的婦女，治療方案或許應聯合常規的化療和指定的小分子抑制劑。

Mardis 說：“我們認為其重要意義是表明對芳香酶抑制劑耐受的患者可能還有其他的治療選擇。隨著我們不斷地向前進展，我們認為測序將提供更多至關重要的信息幫助確定患者最佳的治療方案?！?/SPAN>