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沙眼衣原體全基因組測序完成

日期:2012-03-29 08:46:43

本月《自然—遺傳學》的一份報告公布了沙眼衣原體全基因組序列。沙眼衣原體是一種人體病原體,除了能引發沙眼這種可致盲疾病,還能引發性傳播流行疾病。

 

Simon Harris和同事對53種沙眼衣原體進行了全基因組測序和對比。為保證臨床標本的多樣化,他們從1959年至2009年間發生的多種流行病中挑選出了這些病原體。利用測序數據,他們為該病原體建立了一套更精確的全基因組系統學研究,分析并重建了沙眼衣原體的進化史,這對流行病傳播監測以及病原體種類構成和病株多樣性的鑒定具有潛在意義。

 

研究人員同時發現,通過對ompA這種可對主要外膜蛋白編碼的基因進行分型后,所得到的沙眼衣原體單個基因傳統診斷結論,在病株分型和遺傳相關性推論方面具有一定局限性。他們建議對該基因組中更多的基因座進行分型,以保證病株分型能更精確。


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