Cell:miRNA的生物合成與功能
日期:2012-03-28 08:45:18
疾病往往是由于對生理和病理應(yīng)激作出的異常或不適當(dāng)?shù)姆磻?yīng)所致。在過去的10年里,大量的研究揭示了哪些microRNAs (miRNAs)參與調(diào)控了這些情況下的細(xì)胞行為。在3月16日的《細(xì)胞》(Cell)雜志上,來自德克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心的Joshua T. Mendell和 Eric N. Olson發(fā)表了題為“MicroRNAs in Stress Signaling and Human Disease”的文章,綜述了miRNA調(diào)控應(yīng)激信號的新興原理,并運(yùn)用這些概念理解了miRNA在疾病中的作用。
上接:Cell綜述:應(yīng)激信號與疾病中的miRNA
miRNA的生物合成與功能
編碼大部分哺乳動物miRNA的基因都是通過RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄,這些基因長度有可能達(dá)數(shù)萬個堿基,被多次剪接。大約有三分之一的已知miRNAs嵌入在蛋白編碼基因的內(nèi)含子中,與宿主基因共轉(zhuǎn)錄,從而協(xié)同調(diào)控miRNA和蛋白的表達(dá)。在某些情況下,內(nèi)含子miRNAs與基因編碼蛋白一起參與調(diào)控生物過程。例如miR-33家族成員可與其嵌入的固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白(SREBP)基因協(xié)同作用減少膽固醇流出,促進(jìn)膽固醇合成。
miRNA初級轉(zhuǎn)錄物首先釋放出6080個核苷酸的發(fā)夾結(jié)構(gòu),隨后借助RNase III家族內(nèi)切核糖核酸酶Drosha和Dicer的進(jìn)一步加工生成長度為2122個核苷酸的成熟miRNAs。完全加工的miRNAs與RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RISC)中的Argonaute (Ago)家族蛋白偶聯(lián),成為它們的特異性決定子。miRNAs引導(dǎo)Ago蛋白借助互補(bǔ)位點(diǎn)靶向mRNAs。miRNAs 5’端的短種子序列(28個核苷酸)起著非常關(guān)鍵的作用,在某些情況豐富的種子序列成為優(yōu)選靶區(qū)。當(dāng)借助于相互作用靶向mRNAs時,Ago蛋白發(fā)揮活性導(dǎo)致mRNA翻轉(zhuǎn)(turnover),抑制靶向轉(zhuǎn)錄物的翻譯。
當(dāng)前有大量不同的運(yùn)算方法用于生物信息學(xué)預(yù)測miRNA的靶點(diǎn),通常每種miRNA都預(yù)測有數(shù)以百計(jì)的靶點(diǎn)。這些高度復(fù)雜的靶向網(wǎng)絡(luò)對解析miRNA介導(dǎo)的表型機(jī)制提出了重大的挑戰(zhàn)。當(dāng)前普遍的模型均假定miRNAs的功能是微調(diào)其大量靶基因的表達(dá)。盡管每個靶基因僅受到微妙調(diào)控(通常由于miRNA功能獲得或缺失導(dǎo)致的單個靶蛋白的豐度改變不會超過2倍),然而大量轉(zhuǎn)錄物的協(xié)同調(diào)控所產(chǎn)生的疊加作用卻能夠?qū)е聫?qiáng)大的表型效應(yīng)。不幸的是,這種假設(shè)幾乎還不可能直接檢測,因?yàn)橥瑫r將大量靶mRNA恢復(fù)到體內(nèi)miRNA功能獲得或喪失背景下的自然水平從邏輯上講是難于實(shí)現(xiàn)的。因此,所有來自這些類型靶mRNA的分析結(jié)果都將是相互關(guān)聯(lián)的。
另一方面,一些miRNA介導(dǎo)的功能也有可能受到了一種或一些靶mRNA的強(qiáng)有力調(diào)控作用的驅(qū)動。例如線蟲中的miRNA lin-4下調(diào)蛋白編碼基因lin-14表達(dá),只發(fā)生于幼蟲發(fā)育的適當(dāng)時間。然而,這種線性miRNA 調(diào)控信號通路在哺乳動物中卻極少得到證實(shí)。
證實(shí)單個靶mRNA或多個靶mRNA的單倍型劑量不足(haploinsufficiency)可逆轉(zhuǎn)miRNA缺失表型,提供了最強(qiáng)有力的證據(jù)表明了體內(nèi)特異性miRNA與靶mRNA相互作用的重要性。例如miR-146a靶目標(biāo)Stat1的單倍型劑量不足可以逆轉(zhuǎn)miR-146a敲除小鼠的自身免疫癥狀。然而目前這類的論文結(jié)果還是比較稀缺。將特異的靶mRNA與miRNA介導(dǎo)的表型連接起來仍是一個相當(dāng)大的挑戰(zhàn),還需要開辟出新方法來揭示體內(nèi)miRNA介導(dǎo)的功能機(jī)制。
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