Nature子刊:掌控細胞悄悄話 攻破細菌生物膜
日期:2012-01-16 08:49:04
用彼此聽得懂的語言交談溝通,能讓人們達成共識一致行動,在微生物界也是如此。最近,美國德州農(nóng)工大學研究人員掌握了一種細胞之間的“交談”方式,不僅能精確控制細菌產(chǎn)出化學產(chǎn)品,也能更有效地控制生物膜的形成和解體。這一發(fā)現(xiàn)在醫(yī)療、衛(wèi)生和工業(yè)領域都有著巨大的應用價值,尤其使生物反應器技術向前邁進了一大步。研究論文發(fā)表在近日的《自然·通訊》網(wǎng)站上。
破解細菌生物膜
細菌在大多數(shù)時候并非以單個游離狀態(tài)存在,而是聚集粘結(jié)在一起,形成團塊。細菌本身只占不到1/3的體積,余下空間由細菌分泌的一種黏性物質(zhì)占據(jù)。科學家們將這種黏性物質(zhì)以及被其黏結(jié)而成的細菌團塊稱為“生物膜”。
生物膜能保護細菌對抗外來危險,比如增強它們耐受抗生素的能力,但也是出了名地難分解。生物膜能生長在各種生物和非生物的表面,包括水下巖石、食物、牙齒(形成牙菌斑)、醫(yī)用生物移植材料(如膝蓋和髖關節(jié)等)。細菌生物膜會引起尿道炎、前列腺炎、腎結(jié)石、齲齒等多種疾病,往往還會反復發(fā)作,極難徹底治愈。
領導這項研究的是美國德州農(nóng)工大學化學工程系教授托馬斯·伍德和阿魯爾·杰亞拉曼等人。他們利用細菌之間發(fā)送和接收的特殊信號來引發(fā)生物膜的形成與分解。他們把一段取自綠膿桿菌(Pseudomonas aeruginosa)的基因插入到埃希氏菌(E. coli bacteria)中,使這些埃希氏菌能持續(xù)不斷地發(fā)出一種化學信號。正常情況下,埃希氏菌是不能制造這種信號的。他們還在埃希氏菌中插入了接收機制和一種開關,讓這種信號能持續(xù)不斷地廣播。
然后他們把轉(zhuǎn)基因細菌插入到環(huán)境中的生物膜里,這些已有的生物膜也被改造得能接受這種化學信號。伍德解釋說,一旦接受這種信號,其中的細菌就會打破生物膜離開該處環(huán)境,從而有效破解這些生物膜。
“以前還從未有研究小組發(fā)現(xiàn)過一種蛋白質(zhì)能破解生物膜,并將它們用在合成路線中。我們利用了細胞間的‘交談’信號,對生物膜的控制達到了前所未及的程度。”伍德說。
盡管生物膜會給健康帶來嚴重威脅,但在工業(yè)中卻非常有用,比如制造替代燃料。伍德解釋說,生物膜堅固的特性讓它們成為制作生物反應器的理想材料,生物膜反應器可用來生產(chǎn)多種化學產(chǎn)品,如丙醇和丁醇。由于膜內(nèi)細菌以葡萄糖為食,還能潛在地幫助改變生態(tài)。
讓細菌工廠代替化工廠
“我們的最終目標,是用細菌造出化工廠里能造出來的所有產(chǎn)品。”伍德說,“要實現(xiàn)這一目標,未來的反應器是一種生物膜反應器。一旦有什么意外情況,比如操作反應器的人突然咳嗽起來,也不會造成太大影響。當pH值降低時,生物膜仍能保持堅固,細胞也不會死。如果細胞不在生物膜內(nèi)而是獨立生長,反應器內(nèi)一有什么變化,你就可能失去所有的細胞和它們的產(chǎn)品。”
但要想把這種技術落實到實際應用中,必須能控制多種與膜有關的變量:反應器中能生長多少膜?需要多長時間?不同生物膜的比例是多少?
“我們開發(fā)出一種新的生物膜反應器的縮微模型,能精確控制哪種細菌正在擴張,處在什么時期,以及它們在生長過程中放出了哪種信號。”杰亞拉曼解釋說,“除了能控制反應器,這種技術還讓我們能以一種高流量的方式研究一些實驗條件,這對優(yōu)化生物反應過程非常重要。”研究人員能操控細菌以更高密度生長,或者按某種特殊比例來培養(yǎng)它們。通過控制生物膜的形成和破解,還能讓反應器在限定時間內(nèi),從生產(chǎn)一種產(chǎn)品轉(zhuǎn)換為生產(chǎn)另一種,實現(xiàn)有效準確地生產(chǎn)、加工和提純,持續(xù)不斷地造出合乎要求的化學產(chǎn)品。
“下一步,我們想培養(yǎng)一個由不同菌群組成的“聯(lián)盟菌團”,生產(chǎn)復雜的化學產(chǎn)品。由其中一種菌群造出它的第一部分,另一種菌群造出它的第二部分,兩個菌群可以同時制造不可分開的兩種成分。要實現(xiàn)這一目標,菌群必須按照合適的比例組合,至今還沒有人能做到這一點。但現(xiàn)在利用我們的發(fā)現(xiàn),就能夢想成真。”伍德說。
杰亞拉曼還指出,這些技術還能用于更多方面,如藥物發(fā)現(xiàn)、配制和藥物遞送等,還可模擬人體環(huán)境。比如人們吃下任何藥物,都要通過體內(nèi)的微生物群落才能到達標靶,現(xiàn)在用這種模型,可以反過來按照預定目標和清除藥物分子的能力,評價這種聯(lián)盟菌團的效果。