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Your Good Partner in Biology Research

2011盤點:突破性的RNA檢測技術

日期:2012-01-11 08:43:41

近年來,隨著生物學研究的飛速發展,RNA在生命活動中所行使的多種生物功能及作用機制不斷獲得深入解析。過去科學家們認為RNA的功能僅僅是參與蛋白質生物合成,然而越來越多的研究數據表明細胞中存在著多種不同類型的RNA,這些 RNAs在參與蛋白質的合成之外,還可對細胞內信號傳導和基因表達起重要的調控作用。

 

開發出新的技術加速RNA研究,對于揭示與RNA相關的人類生命活動及疾病無疑具有重要的意義。2011年科學家們在推動RNA研究的技術開發上取得了不少的成果,讓我們來逐個盤點一下:

 

RNA動態追蹤

 

來自美國威爾康乃爾醫學院(Weill Cornell Medical College )的研究人員稱他們開發了一種可以跟GFP蛋白媲美的新型熒光工具,這種被命名為“Spinach”的RNA-熒光基團復合物可用于追蹤細胞內各種RNA的功能動態。這一新技術將幫助推動科學家們揭開與人類生命活動及疾病相關的RNA的神秘面紗。

 

美國哈佛-麻省理工博德研究所的科學家們開發了一種具有高分辨率及廣泛適用特性的新技術用于追蹤細胞內的RNA動態。研究人員稱這項新技術為科學家們了解那些必需RNA分子的生命過程開啟了多個新窗口,并將幫助他們了解細胞中的異常分子事件。

 

新技術具有的廣泛適用度及特異性確保了研究人員可對全過程中RNA水平的變化進行系統的觀察。此外新技術的一個關鍵特征是能夠使研究人員在非常短的時間間隔中獲取RNA水平的“快照”。將這些快照串聯在一起不僅能夠揭示RNA水平變化的機制,還適用于其他方法無法實現的對短時、間期RNA生命過程的檢測。這為我們進入RNA世界開啟了多個窗口。

 

此外,還有來自愛因斯坦醫學院的細胞生物學教授Robert Singer開發了一種新技術實現了在活細胞中觀察RNA的運動情況。Singer教授用黃色熒光蛋白標記mRNA分子,用紅色熒光蛋白標記核孔,通過高速攝像機將mRNA分子通過核孔的過程拍攝下來,從而揭示了mRNA分子如何通過核孔從細胞核進入細胞質的動態機制。這是研究人員第一次在活細胞中實時觀察分子的膜孔轉運。這一方法的優點是測量精度提到了納米級,缺點是這種成像方法中用到的兩個相機拍攝必須完全對齊,這并不是個簡單的工作。

 

RNA定量分析

 

來自瑞典醫科大學卡羅琳斯卡醫學院的研究人員開發了一種分子定量新方法,通過對DNA/RNA分子進行人工標記,使得生成的拷貝能夠很容易區分出它們的初始分子。隨后研究人員利用一種可并行讀取數百萬DNA片段的新型高通量測序儀高效完成了對這些分子的定量。目前采用的多種方法均只能檢測樣品間的相對差異,新技術原理非常的簡單,卻可實現對細胞樣品中的分子精確定量。并且,新技術在對少量細胞進行分子定量方面顯示了特別的優勢。

 

RNAi研究新平臺

 

來自美國冷泉港實驗室沃森生物科學學院,霍德華休斯醫學院等處的研究人員建立了一種可獲得發夾RNA轉基因小鼠模型的快速可擴展系統,從而解決了RNA干擾的轉基因小鼠模型可重復性低的問題。實驗數據顯示這一系統是一個可獲得任何哺乳動物基因RNAi轉基因小鼠的低成本,可擴展平臺。

 

冷泉港實驗室,霍德華休斯醫學院等處的研究人員研發了一種新型技術,能幫助研究人員一次篩選上千候選發夾RNA分子,從中找到能沉默目標基因的RNA分子,這對于提高RNA干擾效率具有積極的意義。目前我們對于小RNA的產生機制了解得并不多,而這一最新方法也許能幫助我們大規模分析這一過程。

 


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