SWATH 采集模式是 Aebersold 博士及其在蘇黎世聯(lián)邦理工學院的團隊共同開發(fā)，為未來的蛋白質組學研究提供的一種新的工作流程，該系統(tǒng)預計將產生令人震撼的蛋白質組學新發(fā)現(xiàn)，并克服目前的質譜平臺中因數(shù)據(jù)重復而給科學家?guī)淼睦Щ蟆１炯夹g關鍵優(yōu)勢在于其能提供樣品的完整定量與定性結果，該結果能按照提出的新假設經電腦模擬進行回溯性的挖掘。

這一新技術是對 MRMAtlas 的完美補充，MRMAtlas 以質譜技術為基礎，向大多數(shù)人類蛋白質組提供研究平臺。全球科學家利用這一圖譜極大推進了生物標志物研究、蛋白藥物開發(fā)、基礎生物及生物醫(yī)學研究。MRMAtlas 提供簡單及有效分析能力，探索蛋白質組中前所未見的新領域。利用 TripleTOF 5600 系統(tǒng)的 SWATH 采集模式，將有更多科學家能使用 MRMAtlas。

現(xiàn)有高分辨率及軌道阱質譜系統(tǒng)僅能定性檢測出復雜樣品中的蛋白質子集，因為它們 MS/MS 獲取速度相對較慢，且為探知更準確的定量結果，常常會采用其他儀器再次進樣分析樣品。面對這些挑戰(zhàn)，AB SCIEX 開發(fā)出 SWATH 采集模式可以在單一進樣分析中同時對所有蛋白質與肽進行定量與定性檢測。

與 Aebersold 博士及其團隊共同展開的這一活動還將繼續(xù)開發(fā)軟件處理方法，更好解析 MRMAtlas 的數(shù)據(jù)。SWATH 采集模式 是 AB SCIEX 的 MS/MS^ALL 技術的延伸，只能在 TripleTOF™ 5600 上完成，這是因為需要將極高的采集速度與定量能力、精確質量及高分辨率整合在一起方可實現(xiàn)。MS/MS^ALL 以前已成功用于脂質組學及特種結構表達。現(xiàn)在進一步擴展此能力，MS/MS^ALL 采用 SWATH 采集模式，極大提高了工作效率，因此可以結合 LC/MS --， 顯著提高了質譜技術。