家蠶基因組甲基化譜完成
日期:2010-07-15 16:43:47
由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院、西南大學、上海腫瘤所等合作的研究成果“家蠶基因組甲基化譜”,5月2日在國際著名學術雜志《自然—生物技術》(Nature Biotechnology)上發表,這是中國科學家在家蠶基因組研究領域取得的又一項重要成果。
作為表觀遺傳學的一種重要標記,DNA甲基化在基因組防御、基因調控等方面都發揮著重要作用。相對于動植物,昆蟲甲基化水平很低,其功能也一直存在爭議。近年來,隨著越來越多昆蟲甲基化基因和甲基化酶的報道,昆蟲甲基化的功能和生物學意義引起了廣泛的興趣。
最近,中國科學院昆明動物研究所王文研究員領導的馬普小組的相輝博士等,與深圳華大基因研究院、西南大學蠶桑學重點實驗室以及上海腫瘤所的朱景德研究員小組共同合作,利用新一代測序技術構建了第一張單堿基分辨率的昆蟲甲基化譜——家蠶絲腺甲基化譜。
研究發現大約0.11%的基因組胞嘧啶被甲基化修飾,比哺乳動物和植物低至少50倍。甲基化區域主要富集在基因區,并且與基因表達水平成正相關。動植物中被報道發揮重要作用的啟動子區、核糖體rDNA區甲基化調控,以及轉座子區的甲基化抑制,在昆蟲中似乎還不具備。
家蠶甲基化譜的完成不但對理解昆蟲表觀遺傳學調控的提供了重要的參考資料,也為進一步發掘家蠶人工馴化過程中潛在的表觀遺傳學貢獻奠定了研究基礎。
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