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BMC:線粒體全基因組分析解決傳統(tǒng)分析難題

日期:2010-06-08 10:30:38

來自中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所,四川大學(xué)等處的研究人員分析了雞形目34個(gè)種的線粒體全基因組,得到了支持率較高的系統(tǒng)樹,為澄清雞形目,特別是雉科長期混淆不清的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系提供了重要的證據(jù)。這項(xiàng)研究為進(jìn)一步研究雉科的快速輻射分化、雌雄二色性多次分化以及飛行能力的多次獨(dú)立退化等提供了很好的基礎(chǔ)。研究近期公布在國際著名雜志BMC Evolutionary Biology 上。

領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是昆明動(dòng)物研究所張亞平院士,其早年畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)生物系,1991年獲中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所博士學(xué)位,主要的研究包括在國內(nèi)較早地、系統(tǒng)地開展動(dòng)物分子系統(tǒng)學(xué)的研究,深入研究靈長類、食肉類、兔形類和嚙齒類的進(jìn)化,在國際上建立了較為全面的熊超科分子系統(tǒng)樹等。近期其研究組接連獲得了多項(xiàng)研究成果。

雞形目是一個(gè)在世界范圍里廣布的種類。雉科在該目里成員最多,關(guān)系最復(fù)雜。中國擁有世界上雉科近1/3的種類,其中又有大約1/3是我國的特產(chǎn)種,有“雉類的王國”之稱。該目包含了人們所熟悉以及有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值的家雞,火雞,鵪鶉等;也包含了很多稀有的觀賞鳥類,比如紅腹錦雞,紅腹角雉,白鷴等。由于它們具有重要的科學(xué)與經(jīng)濟(jì)價(jià)值,雞形目的研究倍受關(guān)注。然而到目前為止,它們的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系仍然混淆不清,很多研究得出互相矛盾的結(jié)果,尤其是雉科物種的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系十分復(fù)雜。

研究人員分析了雞形目34個(gè)種的線粒體全基因組,得到了支持率較高的系統(tǒng)樹,為澄清雞形目,特別是雉科長期混淆不清的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系提供了重要的證據(jù)。該研究結(jié)果提示,傳統(tǒng)上根據(jù)形態(tài)等劃分的雉類、鶉類、孔雀類以及角雉類都不是單系,也就是說雉科形態(tài)發(fā)生了多次的趨同進(jìn)化,導(dǎo)致了依賴外形的傳統(tǒng)分類的困難。

而之前根據(jù)單個(gè)基因或者少數(shù)幾個(gè)基因的研究,各個(gè)節(jié)點(diǎn)支持率很低,留下很多頗有爭議的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。這些問題在本研究中得到較好的解決,說明線粒體全基因組分析是解決這種快速輻射進(jìn)化類群系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的有效途徑。該研究結(jié)果為進(jìn)一步研究雉科的快速輻射分化、雌雄二色性多次分化以及飛行能力的多次獨(dú)立退化等提供了很好的基礎(chǔ)。


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