在线日韩日本国产亚洲丨少妇伦子伦情品无吗丨欧美性猛交xxxx免费看蜜桃丨精品人妻系列无码一区二区三区丨亚洲精品无码不卡在线播放

Your Good Partner in Biology Research

Nature Methods新方法能矯正RNA-seq測序的技術(shù)偏差

日期:2017-03-09 08:50:44

 基因表達(dá)分析正越來越多地用于癌癥的診斷和檢測,是生物學(xué)研究的主要工具,一種新型的計(jì)算方法可以提高基因表達(dá)分析的準(zhǔn)確性。

 

來自卡耐基梅隆大學(xué)和紐約州立大學(xué)石溪分校的研究人員稱,他們的方法(被稱作Salmon)能夠矯正轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(RNA-seq)中的技術(shù)偏差。而且這種技術(shù)預(yù)估基因表達(dá)水平的速度也與其它快速方法相當(dāng)。

 

他們的方法已發(fā)表于36日的Nature Methods雜志,并且Salmon的資源代碼已經(jīng)被成千上萬的用戶免費(fèi)下載。

 

來自卡耐基梅隆大學(xué)計(jì)算生物學(xué)系的助理教授Carl Kingsford說,SalmonRNA-seq實(shí)驗(yàn)及其可能存在的偏差提供了更豐富的計(jì)算模型。為這種技術(shù)越來越多的應(yīng)用于疾病和其壓型的分類、了解發(fā)育過程中的基因表達(dá)變化、以及跟蹤癌癥的進(jìn)程等提供了重要的保障。

 

盡管生物體基因的構(gòu)成是靜態(tài)的,但是個體基因的活動是隨著時間的推移而變化的,這使得基因表達(dá)成為理解生物體工作方式,以及疾病過程中發(fā)生了什么,的重要指標(biāo)。基因的活性雖然不能被直接測量,但可以通過監(jiān)視RNA來進(jìn)行推斷。

 

RNA-seq是目前捕捉基因活性的領(lǐng)先技術(shù)。但是,根據(jù)由于不同組織、不同制備方法、不同實(shí)驗(yàn)誤差,導(dǎo)致RNA-seq的讀數(shù)也會比實(shí)際偏高或偏低。

 

雖然我們知道會存在許多偏差,但是在對它們建模時還是會發(fā)生樣品循序的偏差。為此,倘若你準(zhǔn)備用傳統(tǒng)的方法建立一個更復(fù)雜的偏差模型,那將是非常耗時的。

 

Salmon結(jié)合了一個新的雙相位并行推理算法、功能豐富的偏差模型,以及超快速讀取映射程序。這是第一個能正確測量GC片段偏差的,全轉(zhuǎn)錄組水平測量技術(shù),能大幅度提高豐度估值的準(zhǔn)確性以及差異表達(dá)分析的靈敏度。

 

Salmon算法得名于一種擅長逆流而上的魚——鮭魚。當(dāng)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)“流過”時,該種算法可以直接估計(jì)出偏差的影響和基因表達(dá)水平。因此,它可以像其他快速分析工具一樣,迅速而準(zhǔn)確地得知基因表達(dá)水平。

 

特別關(guān)注

主站蜘蛛池模板: 99精品国产兔费观看久久99| 狠日狠干日日射| 浓毛欧美老妇乱子伦视频| 国产麻豆剧传媒精品国产av| 波多野结衣 黑人| 97人洗澡从澡人人爽人人模| 把腿张开老子臊烂你多p视频 | 亚洲国产av天码精品果冻传媒| 熟妇无码熟妇毛片| 少妇精品无码一区二区免费视频| 中国少妇无码专区| 污18禁污色黄网站免费| 热re99久久6国产精品免费| 免费裸体无遮挡黄网站免费看| 欧美最猛性xxxxx免费| 午夜成人爽爽爽视频在线观看 | 久久久久77777人人人人人| 亚洲成av 人片在线观看无码 | 少妇高潮毛片免费看| 久久久久人妻精品一区三寸| 国产在线码观看超清无码视频 | 97久久婷婷五月综合色d啪蜜芽| 天堂在线.www天堂在线资源| 中国少妇内射xxxx狠干| 欧美激情精品久久久久久| 日本少妇xxx做受| 日本丰满人妻xxxxxhd| 久久久久无码国产精品一区| 中国熟妇牲交视频免费| 成人免费无码不卡毛片| 亚洲小说春色综合另类| 无码精品一区二区三区在线| 无码一区二区三区老色鬼| 国产精品偷伦视频观看免费| 亚洲精品国产a久久久久久| 日本丰满护士bbw| av无码av在线a∨天堂毛片| 激情综合婷婷丁香五月| 日本强伦片中文字幕免费看| 亚洲欧洲精品a片久久99| 亚洲最大成人av在线天堂网|