在线日韩日本国产亚洲丨少妇伦子伦情品无吗丨欧美性猛交xxxx免费看蜜桃丨精品人妻系列无码一区二区三区丨亚洲精品无码不卡在线播放

Your Good Partner in Biology Research

Sci Rep:PRC2與lncRNA相互作用的序列特異性新發現

日期:2017-02-14 09:04:04

 國際學術期刊《科學報告》(Scientific Reports)近期在線發表了中國科學院-馬普學會計算生物學伙伴研究所邵振研究組關于PRC2與長非編碼RNAlncRNA)之間相互作用的序列特異性研究成果。

 

由多梳(PcG)家族蛋白組成的表觀調控復合物PRC2是控制動物組織發育的重要因子,但在高等動物中PRC2如何被特異性招募到染色質特定區域的分子機制還不清楚。隨著XISTHOTAIRPRC2結合lncRNA的發現,人們猜測此類lncRNA可能決定了PRC2染色質招募的特異性(Margueron et al. Nature 2011)。但是,直到現在PRC2RNA結合是否具有序列特異性仍被廣泛爭論(Davidovich et al. Mol Cell 2015)。

 

邵振研究組首先開發了一個基于馬爾可夫鏈思想的序列組成分析流程,通過計算不同核苷酸間轉移在每條序列中出現的頻率來刻畫其組成,進而選擇被特定序列所顯著偏好或不偏好的核苷酸間轉移作為它們的序列組成特征,并通過將所有可能的轉移映射到一個完整四叉樹來研究所選序列特征在特征空間中的分布是否具有非平凡性。通過將該流程應用于人基因組中已知的數百個PRC2結合lncRNA,該研究系統分析了這些lncRNA的序列特征,發現其偏好的序列特征傾向在四叉樹上組成連續偏好路徑,并且這些連續路徑上的序列特征傾向于同時被人和小鼠基因組中的PRC2結合lncRNA所偏好。

 

受此啟發,該研究整合小鼠胚胎干細胞中兩組已發表的RIP-seqCLIP-seq數據,定義了一組高可信度的小鼠PRC2結合lncRNA,發現這些lncRNA能夠被人基因組中已知PRC2結合lncRNA所具有的序列特征較好地預測。這些研究發現表明高等動物中PRC2lncRNA結合具有序列特異性,并且其特異性具有較高的跨物種保守性。此外,該研究還通過發展一個局域打分模型,發現PRC2結合lncRNA的序列特征在lncRNA上的分布表現出明顯的非隨機性。進一步研究發現,每個lncRNAPRC2lncRNA結合所偏好序列特征最富集的小片段(定義為PRC2偏好片段),相對lncRNA其它部分具有顯著更高的進化保守性和RIP-seq信號強度(如圖),說明這些序列特征的局域富集具有明確的功能意義。

 

該項研究在研究員邵振指導下,由計算生物學研究所博士研究生涂世奇完成,并得到了中科院和上海市科委的經費支持,以及美國哈佛醫學院教授袁國丞的指導和協助。

 


主站蜘蛛池模板: 亚洲男人天堂| 亚洲爆乳成av人在线蜜芽| 国产福利在线永久视频| 性一交一乱一乱一视频| 国产精品无码久久久久久久久久 | 同性男男黄g片免费网站| 中国女人和老外的毛片| 女人裸露免费视频无遮挡网站| 国产自在自线午夜精品| 粗大的内捧猛烈进出| 国产日韩精品一区二区三区在线| 亚洲婷婷综合色香五月| 日本人妻精品免费视频| 国产精品免费大片| 九色porny丨国产首页注册| 亚洲精品国产综合久久一线| 99大香伊乱码一区二区| 久久人妻av无码中文专区| 亚洲中文字幕无码av| 国产成人国拍亚洲精品| 国产乱了伦视频大全亚琴影院| 牛牛视频一区二区三区| 国产又黄又刺激又高潮的网站| 色偷偷www.8888在线观看 | 国产真实伦对白全集| 邻居少妇张开腿让我爽了一夜 | 少妇中文字幕乱码亚洲影视| 99riav国产精品视频| 国产av亚洲aⅴ一区二区| 大伊香蕉精品视频在线| 亚洲色偷偷色噜噜狠狠99网| 日日躁狠狠躁狠狠爱| 国产三级精品三级在线专区| 色av专区无码影音先锋| 精品国产av 无码一区二区三区| 人与禽交av在线播放| 狠狠做久久深爱婷婷| 日本xxx在线观看免费播放| 欧美国产精品日韩在线| 国产99视频精品免视看9| 成人免费乱码大片a毛片|