第二軍醫大Nature子刊發表lncRNA新發現
日期:2016-11-08 08:45:59
長非編碼RNA(lncRNA)是一些長度超過二百個核苷酸的RNA分子,來自于基因組的非編碼區域。雖然lncRNA沒有編碼任何蛋白質,但它們在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性,這說明lncRNA具有重要的生物學意義。
在測序技術的幫助下人們已經發現了數千種lncRNA,但這些lncRNA的生物學功能依然還是個謎。第二軍醫大學的研究人員在Nature Communications雜志上發表文章,揭示了一種lncRNA控制人胚胎干細胞(hESC)自我更新的分子機制。文章通訊作者是第二軍醫大學的劉厚奇(Houqi Liu)教授和Yue Wang。
生長停滯特異性轉錄本5(GAS5)是一種與生長停滯有關的lncRNA,也是已知的腫瘤抑制者。研究人員發現,GAS5在hESC中高水平表達,并且被多能性因子OCT4和SOX2直接調控。研究顯示, GAS5敲低會嚴重損害hESC的自我更新,過表達則會顯著促進hESC自我更新。進一步研究表明,GAS5能保護NODAL使其免于降解,由此維持NODAL信號傳導。
研究指出,上述多能性因子、GAS5和NODAL形成了一個維持hESC自我更新的前饋信號回路。鑒于GAS5的這種調控功能具有干細胞特異性,研究人員提出lncRNA的功能可能在不同類型細胞中是不一樣的。
人們發現,有些lncRNA通過RNA-蛋白互作招募調控復合物,進而影響附近基因的表達。可能正是因為這個原因,lncRNA表達往往與附近基因的表達相關。不過,這種關聯分析起來并不容易。Broad研究所的科學家們最近在這方面取得了重要成果。他們在Nature雜志上發表文章揭示了lncRNA對基因表達的本地調控機制。
中科院生物物理所的科學家們對肝癌進行深入研究,鑒定了一種支持肝癌干細胞自我更新的lncRNA(lnc-β-Catm)。這項重要研究成果于五月三十日發表在Nature Structural & Molecular Biology雜志上,文章通訊作者是中科院生物物理所的范祖森(Zusen Fan)研究員。
中科院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所的研究團隊鑒定了一種源自多順反子轉錄本的lncRNA。他們在Molecular Cell雜志上發表文章指出,一種不尋常的加工機制會生成能隔離多個RNA結合蛋白的SPA LncRNA。
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