新測(cè)序技術(shù)將徹底改變白血病治療
日期:2016-10-18 08:44:24
在白血病這種疾病中,每個(gè)細(xì)胞都可能表現(xiàn)出不同的遺傳性狀,現(xiàn)在,來(lái)自瑞典的研究人員已經(jīng)找到了一種廉價(jià)的方法來(lái)檢測(cè)單個(gè)細(xì)胞。這一研究突破發(fā)表在10月14日的《Nature Communications》,可能徹底改變白血病的治療。
細(xì)胞內(nèi)擠滿了基因信息,它們可以用來(lái)改善疾病治療,如癌癥,但今天通常使用的RNA測(cè)序方法存在一個(gè)限制:它們不能確定哪個(gè)細(xì)胞中正在發(fā)生基因活動(dòng)。
最近在《Nature Communications》發(fā)表的研究中,瑞典的研究人員提出了一種新方法,他們用該方法來(lái)檢測(cè)慢性淋巴細(xì)胞白血?。?span lang="EN-US">CLL)患者的單個(gè)腫瘤細(xì)胞,考慮到該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)白血病腫瘤是由具有完全不同的基因表達(dá)的細(xì)胞組成,這項(xiàng)研究結(jié)果可以說(shuō)是一個(gè)重要突破。
瑞典皇家理工學(xué)院基因技術(shù)教授和生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室基因組學(xué)平臺(tái)主任Joakim Lundeberg說(shuō):“我們發(fā)現(xiàn),CLL細(xì)胞并不只包含一種單一的細(xì)胞類型,而是多個(gè)亞克隆,它們表現(xiàn)出完全不同的基因表達(dá)。”
通常情況下,RNA測(cè)序能夠提供有關(guān)“生物樣品中存在什么RNA分子”的信息,而不是“它們?cè)谀睦锘蚰膫€(gè)細(xì)胞內(nèi)是活躍的”這樣的信息。
他說(shuō):“有了這種新的、非常符合成本效益的技術(shù),我們現(xiàn)在可以對(duì)血液腫瘤樣本內(nèi)的這種復(fù)雜性獲得一個(gè)全新的看法。單細(xì)胞的分子分辨率,有可能成為一種更廣泛使用的治療選擇。”
Lundeberg說(shuō),這種方法可將一個(gè)位置標(biāo)簽附加到分子上,對(duì)單個(gè)細(xì)胞中所有的mRNA分子進(jìn)行分析。
研究人員在一個(gè)特制的玻璃表面上對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行分類,并用新一代測(cè)序?qū)?span lang="EN-US">RNA分子進(jìn)行分析,就可以確定哪些基因是活躍的。玻璃表面上的空間信息,可以告訴我們一個(gè)特定的RNA分子是在哪一個(gè)細(xì)胞內(nèi)被發(fā)現(xiàn)的。
Lundeberg表示:“我們還開(kāi)發(fā)了一個(gè)開(kāi)放的、可用的軟件(www.spatialtranscriptomicsresearch.org),可將單個(gè)細(xì)胞的圖像與來(lái)自測(cè)序的信息結(jié)合起來(lái),即,哪些基因被表達(dá),以及在什么水平上表達(dá)。”他說(shuō):“用新的方法和軟件,我們可以在一天的時(shí)間內(nèi)研究成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞。”