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Science發表有里程碑意義的RNA測序研究

日期:2016-08-22 09:07:31

 全基因組關聯研究(GWAS)鑒定了數百個心血管代謝疾病(CMD)的風險位點。這些DNA位點大多位于非編碼區域,但人們對相應的基因調控機制還知之甚少。西奈山伊坎醫學院的研究人員對六百名冠心病患者的不同組織進行了基因分型和RNA測序。

 

“通過分析多個組織的基因表達數據,我們鑒定了在單一組織起作用的致病基因,也發現了以網絡形式跨組織起作用的致病基因,”這篇文章的資深作者,西奈山伊坎醫學院的Johan Björkegren教授說。

 

這是首次對冠心病(CAD)患者血液、血管和代謝組織的RNA序列進行系統性分析。這項具有里程碑意義的研究是STARNET項目的一部分,于八月十九日發表在Science雜志上。

 

“全基因組關聯研究鑒定了大量會提升CAD風險的DNA變異,”Dr. Björkegren。“然而,全基因組關聯研究只是了解CAD的第一步,要將風險指標轉化為新的診療機遇,我們必須邁入下一個階段,找到受這些DNA變異影響而推動疾病發展的基因。此外,我們也需要了解疾病基因在哪些組織、通路和分子網絡中起作用。像STARNET項目這樣鑒定疾病驅動基因和相應組織,是實現精準醫療和個性化診療的前提。”

 

STARNET項目是Dr. BjörkegrenArno Ruusalepp2007年啟動的。研究人員在冠狀動脈搭橋手術中收集了600CAD患者的一些關鍵組織。他們發現,這些組織中的基因表達數據能夠提供寶貴的信息,不僅可以揭示CAD致病基因及其活性,對研究其他心血管代謝疾病和阿爾茨海默癥也很有幫助。

 

“我們驚訝的發現,除了肝臟以外,腹部脂肪對于調控血脂水平也很關鍵,”文章第一作者Oscar Franzén博士說。“舉例來說,控制低密度脂蛋白(LDL)血液水平的PCSK9基因居然是在腹部脂肪中起作用的,而不是在調控血脂水平的主要場所——肝臟。” 最近,PCSK9作為降脂藥物的新靶標受到了很大的關注。

 

STARNET這樣的基礎研究項目有助于探索CAD和其他復雜疾病的病因,“此前GWAS鑒定了不少DNA位點,我們明確了這些位點影響的基因。研究顯示,許多基因所在的調控網絡涉及多種組織和疾病,”文章的另一位資深作者Eric Schadt教授說。現在研究人員正在與阿斯利康和SciLifeLab合作,嘗試開發新的藥物靶標。

 

冠心病是一種臨床上常見的疾病,嚴重威脅著人類的健康。在冠心病中,由于冠狀動脈病理性改變,脂肪沉著堆積在冠狀動脈內膜細胞內并引起血流阻塞。這種疾病與血液中的脂肪含量有關,包括低密度脂蛋白(LDL膽固醇)、高密度脂蛋白(HDL膽固醇)和甘油三酯。近10年來,隨著生活水平的提高和平均壽命的延長,我國冠心病發病率正在逐年上升,而且還有年輕化的趨勢。

 

Ottawa大學、Oxford大學和Broad研究所的科學家們在一項大規模研究中解決了心血管領域的一個長期爭議。研究人員通過千人基因組計劃(1000 Genomes project)的數據庫,獲得了將近一千萬遺傳學變異(SNP)的信息,涉及全球48項研究的六萬冠心病患者和十二萬健康人。他們對冠心病(CAD)的遺傳學背景進行了全面的考察。研究顯示,這種常見疾病的遺傳易感性主要取決于影響較小的普通SNP,而不是影響較大的罕見變異。

 

人們已經了解了LDL在心臟病中的作用,并將其作為statin類藥物的作用靶標。但HDL、甘油三酯和心臟病之間的關聯仍舊未能闡明。Broad研究所、麻省總醫院等機構的科學家們通過大規模外顯子測序發現,APOC3基因上的四個突變不僅能降低血液中的甘油三酯水平,還能顯著減少個體患冠心病的風險(約40%)。這項研究發表在《新英格蘭醫學》雜志上,為人們提供了治療冠心病的新途徑。

 

頂級醫學期刊《柳葉刀》發表的一項大規模研究表明,工作時間長會顯著提升中風和冠心病的患病風險。加班加點地工作的確不利于健康,甚至會危及你的生命。倫敦大學學院的研究人員用25項研究的數據分析了工作時間與冠心病之間的關系。他們發現,與標準工作時間(每周工作35-40小時)相比,每周工作55小時以上會使冠心病風險提高13%

 


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