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中美科學家用CRISPR制備腎癌模型

日期:2016-07-07 09:27:33

 轉移性腎細胞癌(mRCC)幾乎是無法治愈的,是RCC有關的高死亡率的主要原因。Von Hippel Lindau (VHL)是一個腫瘤抑制基因,在大多數(shù)的透明細胞RCCccRCC)病例中是缺失的。然而,它對于缺氧誘導因子-1α(HIF-1α) -2α (HIF-2α)的調控發(fā)揮了什么作用,還沒有得到很好的研究。

 

630日,Nature子刊《Scientific Reports》在線刊登了加州大學洛杉磯分校、華中科技大學同濟醫(yī)學院的一項最新研究成果,題為“CRISPR-Mediated VHL Knockout Generates an Improved Model for Metastatic Renal Cell Carcinoma”。這項研究的通訊作者是加州大學洛杉磯分校的華裔教授吳若萍(Lily Wu)。華中科技大學同濟醫(yī)學院的Hua XuWei Guan等人是本文共同作者。

 

mRCC的治療方案是有限的,因為這種腫瘤對傳統(tǒng)化療和放療表現(xiàn)出耐藥性。治愈這種疾病的一種療法是白介素-2IL-2)療法,但是只作用于大約7%的患者。最近發(fā)展起來的靶向療法——包括靶定免疫檢查點抑制劑程序性細胞死亡-1PD-1)的療法,表現(xiàn)出一定的功效。但是,還缺乏持久的干預措施來對抗mRCC,從而迫切需要一種疾病模型,并深入了解這種疾病的驅動機制。

 

我們對于ccRCC的了解來自于對腫瘤抑制基因VHL的研究。遺傳性的VHL綜合征病例表現(xiàn)出ccRCC的發(fā)展風險升高。隨后的研究表明,這個基因在高達90%的散發(fā)性ccRCC病例中是沉默的。VHL通過識別和靶定缺氧誘導因子(HIF-1α, HIF-2α和HIF-3α)的α亞基用于泛素化和降解,而調控著缺氧反應。在低氧條件下,VHL不能識別HIF-αs,它們通過與HIF-1β結合來易位到細胞核中,并制定缺氧反應所必需的轉錄程序。

 

研究人員試圖通過敲除VHL,來制備ccRCC的小鼠模型。最近的研究表明,除了VHL之外,Bap1的缺失可有助于更一致地制備ccRCC小鼠模型。雖然其中一些研究顯示出早期囊性ccRCC變化和局部腫瘤的跡象,但是這些研究無法產生這種疾病的侵襲性、轉移性形式。為此,許多研究都依賴于RENCA模型,最廣泛使用的RCC免疫活性小鼠模型。盡管這種小鼠模型的效用已經得以證明,但是科學家們最擔心的問題是,其在野生型VHL表達中的臨床適用性。

 

以前的研究表明,VHL缺失可促進一種更具侵襲性和轉移性的腫瘤模型。有大量研究表明,靶定VHL功能可能導致一小部分的上皮間質轉化(EMT)。這個過程已被確定為一個中心節(jié)點,腫瘤通過這個過程從它們的原發(fā)部位轉移到身體其他部位。EMT涉及到細胞間接觸的減少,以及從上皮細胞基底膜上脫離,轉化為一種更為移動性和侵襲性的細胞類型。這些表型變化的同時,是各種各種的分子變化,包括上皮標記的缺失,例如在臨床ccRCC標本中常見的E鈣粘素,還有一些間葉細胞標記的獲得,例如N鈣黏著蛋白和α-SMA。值得注意的是,許多研究證明了HIF-1α對于推動這些變化的作用。此外,HIF-1α已被證明可在其他腫瘤轉移模型中導致轉移。這些結果表明,在RENCA 模型中刪除VHL,可能會產生一種更具轉移性的臨床相關模型。

 

CRISPR基因操縱方法最近已被用于常規(guī)實驗室研究。這一突破性的基因敲除技術,因為易用性和完全敲除基因功能的有效性而著名。基于釀膿鏈球菌適應性免疫系統(tǒng),這種以RNA為基礎的基因組編輯技術,已迅速在許多生物研究中證實了其效用。研究人員開發(fā)出CRISPR方法,是為了生成基因敲除小鼠,在細胞系中進行全基因組篩查,在小鼠體內敲除基因,并在體內篩查轉移性的基因。然而,迄今為止,很少有研究證明CRISPR介導的小鼠細胞系修改,來生成改進的可移植小鼠腫瘤模型。

 

在這項研究中,研究人員利用CRISPR基因組編輯工具,敲除RENCA細胞中的VHL表達。他們發(fā)現(xiàn),在RENCA模型中,CRISPR / Cas9介導的VHL敲除,可導致指示EMT的形態(tài)學和分子改變,進而驅動到肺部的轉移增加。HIF-1α缺陷型的RENCA細胞,在VHL敲除后不能發(fā)生EMT

 

RNA-seq顯示,幾個HIF-1α調控的基因,在VHL基因敲除的細胞中是上調的,它們的過度表達意味著,癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中一種更具侵襲性的ccRCC。在一個新的臨床數(shù)據(jù)集中的獨立驗證證實,相對于鄰近的正常組織,這些基因在ccRCC樣本中是上調的。這些結果表明,VHL的缺失可能通過穩(wěn)定RCC中的HIF-1α而驅動腫瘤細胞的傳播。更好的理解這個現(xiàn)象背后的機制,可以指導科學家們尋找更有效的療法對抗mRCC

 

科學家們對腎癌這種疾病進行了深入的研究。20148月,貝勒醫(yī)學院帶領的一個國際科學合作項目,發(fā)現(xiàn)了可能導致腎嫌色細胞癌的遺傳學改變的線索,不僅為這種罕見癌癥,也為其他類型癌癥,提供了新的見解。相關研究結果發(fā)表在2014821日的國際著名期刊《Cancer Cell》。相關閱讀:測序揭示罕見腎癌的獨特遺傳變化。

 

201512月,Cell雜志的“SnapShot: Renal Cell Carcinoma”這篇文章總結了目前關于這種癌癥基因全景圖中的幾個關鍵特征,主要途徑,腫瘤演變和異質性等多方面內容,并且也介紹了腎細胞癌的相關治療進展。

 

今年3月份,貝勒醫(yī)學院的一個研究團隊深入分析了近900個腎癌樣本。過去人們根據(jù)腎癌細胞在顯微鏡下的特征將腎癌分為三個大類。而這項研究表明,在分子水平上腎癌還可以進一步分為九個亞類。這些腎癌亞類各具特征,受到影響的分子通路和患者的生存情況也大相徑庭。

 


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