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Nature子刊發布突破性單細胞標記技術

日期:2016-05-27 08:53:54

 加拿大蒙特利爾大學和麥吉爾大學的研究團隊在Nature Communications雜志上發布了一種強大的單細胞標記技術。這種光漂白細胞標記法(CLaP)將成為研究者們的寶貴工具,廣泛用于各個領域的科學研究,特別是基因組學研究。

 

“我們把激光當作畫筆,一個一個地標記細胞,”蒙特利爾大學副教授Santiago Costantino說。“過去,標記特定細胞需要事先知道它的分子信息,否則只能通過非特異性方法標記一大群細胞。我們開發的新技術僅僅根據觀測信息來涂色,比如只標記體形大的細胞、速度快的細胞或者瘦長的細胞。隨后,人們可以在分子水平上研究了這些細胞的特殊之處。這種標記技術能夠在數百萬正常細胞中找到罕見的特殊細胞。”

 

CLaP使用起來非常簡單,成本也不高,適合標準共聚焦顯微鏡。CLaP能夠通過自動化實現高通量標記,并且對細胞沒有任何損傷。這種用途廣泛的非侵入性高效標記法,將大大推動新一代測序在單細胞基因組領域的應用。

 

近年來蓬勃發展的單細胞基因組學研究改變了人們對許多疾病的認識。越來越多的研究表明,隱藏在數百萬細胞中的罕見細胞會起到重要的作用。“我們開發的技術可以幫助人們挑出這些細胞,進行一系列過去無法實現的試驗,”麥吉爾大學助理教授Dr. Claudia Kleinman說。

 

多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。但科學家們發現,每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定的基因組合,即使是同類細胞,基因表達也會出現差異。The Scientist雜志最近聯系了單細胞研究領域的一些專家,請他們分享了在單細胞中進行轉錄研究的秘訣。希望幫助研究者們更好地構建文庫,處理和分析結果數據。

 

單細胞基因組旨在通過組學方法研究單個細胞。近年來隨著技術的發展,這一年輕的領域正在迅速成熟起來。單細胞基因組研究的前身可以追溯到用芯片檢測單細胞的基因表達。不過,新一代DNA測序才是單細胞基因組學的大功臣,這些技術的出現讓單細胞基因組研究最終一飛沖天。

 

統計和計算方法是單細胞基因組研究的核心,只有正確的方法才能幫助我們從數據中提取有意義的生物學信息。前不久,德克薩斯大學MD安德森癌癥中心的研究人員開發了首個用于單細胞DNA測序的突變檢出程序——Monovar,這一重要研究成果發表在Nature Methods雜志上。研究人員認為Monovar是單細胞測序評估SNV的一大進步,能夠為人們提供多種疾病的關鍵信息。

 


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