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Nature聚焦已知的第二大蛋白

日期:2016-01-15 09:00:05

 獲得巨酶megaenzyme)的清晰圖像并非易事。但這肯定是值得的。這些蛋白在制造許多常見抗生素中起著積極的作用。它們在不斷地運動,某些部分可以像耍雜技一樣翻轉來執行必要的任務。

 

現在,麥吉爾大學的研究人員第一次獲得了在運轉中的這樣一種藥物合成酶,其一個大的組成部分的一系列三維圖像。研究人員認為,他們生成的這些圖像不僅可以讓科學家們更深入地了解許多抗生素的生成機制,通過進一步的研究還可能促使開發出迫切需要的新一代抗生素。他們的研究成果發布在113日的《自然》(Nature)雜志上。

 

論文的資深作者、麥吉爾大學生物化學系的Martin Schmeing教授說:“這是我們看到過的運轉中的這些酶的最完整圖像。盡管巨酶是人們已知的第二大蛋白,它們仍然是極小的分子,且非常易變,因此難以看到運轉中的它們。”

 

抗菌藥物

 

研究人員正在研究的酶對于生成從青霉素到環孢菌素等一系列的抗生素起至關重要的作用。這些非核糖體合成酶(NRPSs)在特定細菌內部發揮催化劑作用,使得它們能夠殺死所有的競爭細菌。

 

NRPSs像小型的裝配線那樣起作用,通過重復的化學反應組合一些構件。就像汽車裝配線一樣,這些酶的組裝線是由不同的工作站(稱作為模塊)構成,每個模塊添加藥物的一個組成部分,在這一過程中制造出了具有新化學特性的抗生素。

 

讓蛋白質不能活動來給它們拍照

 

由于這些酶太小無法看到,且不斷地在運動,Schmeing教授和他的研究小組利用了一些化學陷阱來捕獲期望位置上的蛋白質。他們隨后利用X-射線晶體學技術獲得了生成抗生素短桿菌肽的NPRS第一個模塊的一系列3D圖像。

 

論文的第一作者、博士生Janice Reimer 說:“這些3D圖像揭示出了NRPS發揮作用合成其產物的完全不同尋常的方式。以往曾獲得過其他NRPSs組成元件的圖像,但卻從未獲得過如此多不同合成步驟的快照,及將感興趣的化學修飾整合到抗生素中去的NRPSs的圖像。這些圖像揭示出了這些組成部分改變它們有限表面的用途并重新利用它們來與酶的其他組成部分相互作用的精細方式。一旦我們獲得充分的認識,就可以利用現代生物工程技術改造NRPSs來生成各種各樣帶有設計修飾的產物,有可能提供一個真正的新藥寶庫。”

 


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