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2016值得關注的技術:高多重成像

日期:2016-01-06 09:05:14

 

今年第一期《Nature Methods》評出了2015的年度技術——單顆粒冷凍電鏡(cryo-EM)。除此之外,該雜志還對一些熱門技術進行了一番展望,包括細胞內蛋白標記、精準光遺傳學、高多重成像、亞細胞圖譜分析等等。
 
熒光團之間的光譜重疊,是成像復雜生物學結構的一個主要障礙。這種限制讓絕大多數實驗只能檢測三、四個靶標。我們怎樣才能看到一個多彩的細胞呢?多重成像可以做到這一點。多重成像能在更有意義的環境中觀察分子,更好地分析多成分復合物的形成和改變。這種技術終將轉變我們對生物學過程的理解。
 
為了解決多重成像目前面臨的問題,人們正在開發更好的探針。比如跨越可見光區和不可見光區的探針,這些探針可以帶來更多的顏色選擇。還有一種稱為intracellular laser的探針,它們的光譜很窄,比較容易區分開。這些探針方面的改進,有助于用標準顯微鏡實現更好的多重成像。
 
此外,研究者們還在開發光學裝置來檢測光譜重疊的熒光團。舉例來說,華人學者Ke Xu及其同事搭建了SR-STORM顯微鏡(spectrally resolved stochastic optical reconstruction microscopy),通過真彩超高分辨率顯微成像獲得每個標簽分子的光譜和位置信息。這一方法能夠輕松辨別光譜高度重疊的熒光團,為人們打開了多靶標成像的大門。
 
高度多重的免疫熒光成像技術也在不斷涌現。研究者們先用抗體標記一組靶標,并且進行成像。然后漂白或剝除探針,再以同樣的方式標記不同靶標。反復多輪標記之后就能建立起高多重圖像。華裔學者蔡龍通過這樣的策略完成了高多重轉錄組成像,在多輪成像之后利用獨特條碼鑒定不同的轉錄本。
 
莊小威實驗室開發的單分子成像技術MERFISH(multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization),是一種高度多重化的smFISH成像方法,可以在單個細胞中鑒定數千種RNA的拷貝數和空間定位,打破了之前的技術局限。
 
雖然上文提到的方法都很強大,但活細胞多重成像仍然需要方法改良。活細胞與固定細胞的多重成像有相同的問題,但也面臨著一些特別的挑戰。舉例來說,活細胞可用的熒光染料和探針比較少,需要快速圖像獲取,而且對光照敏感。
 
相信在不久的將來,人們會開發出大規模多重成像的實用策略,進一步探索細胞中發生的生物學過程。
 

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