華裔學者Nature綜述:lncRNA的獨特之美
日期:2015-12-29 09:15:17
幾乎整個人類基因組都會轉錄成RNA,但只有一部分RNA被用于蛋白質生產。科學家們逐漸意識到,非編碼RNA并不是基因組中的垃圾序列,而是許多基礎生命過程的核心,有著廣泛的生物學功能。然而,大多數RNA(非編碼轉錄組)的功能還是未知的,長非編碼RNA就是其中之一。
長非編碼RNA(lncRNA)是長達兩百個核苷酸以上的轉錄本,絕大多數位于細胞核內。雖然lncRNA沒有編碼任何蛋白質,但它們在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性,這說明lncRNA具有重要的生物學意義。在測序技術的幫助下,人們已經發現了數千種lncRNA,但這些lncRNA的生物學功能依然還是個謎。
哈佛大學醫學院的研究人員日前在Nature Reviews Genetics雜志上發表文章,探討了lncRNA生成和功能的獨特之處。文章的通訊作者是哈佛大學醫學院的華裔學者Howard Y. Chang。Howard Chang教授曾入選HHMI2009年早期職業科學家項目(2009 Early Career Scientist Program),獲得百萬美元資助。這項計劃會在6年中為每一位入選科學家提供包括薪酬,福利和研究預算在內的,超過150萬美元的經費支持,這些科學家也會被聘為霍華德休斯醫學研究院的全職研究員。近幾年Howard Chang教授多次在頂級期刊上發表重要成果。
人們最初發現lncRNA的時候,將其稱為不編碼蛋白的mRNA樣轉錄本。后來的研究顯示,lncRNA具有與mRNA不同的獨特屬性。Chang教授通過這篇文章系統描述了lncRNA一生(轉錄前、轉錄中和轉錄后)中發生的特殊事件,探討了這些事件對lncRNA的塑造作用。
文章指出,在忙碌的一生中(從生物合成、成熟到降解),lncRNA受到的調控往往和mRNA并不相同。與mRNA相比,lncRNA會經歷特殊的轉錄后加工,比如MALAT1和NEAT1。此外,很多lncRNA通過順式作用對旁邊的基因組位點進行調控,其轉錄位置也很重要。
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