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個性化醫(yī)療技術(shù)幫助,使epigenomic分析只有100個細胞

日期:2015-07-31 11:33:58

一項新技術(shù),將大大提高調(diào)查的表觀基因組,打開和關(guān)閉基因的機器和一個非常重要的研究領(lǐng)域疾病的干細胞分化、炎癥和癌癥。

表觀基因組的考核需要映射在整個基因組DNA與某種相互作用蛋白質(zhì)。 這可能epigenomic特性允許醫(yī)生創(chuàng)建個性化治療的疾病,通過了解病人的狀態(tài),使預報,并相應調(diào)整治療策略。 然而,這樣的測試需要大量的 細胞 。 體內(nèi)全基因組的研究一度protein-DNA交互和染色質(zhì)的修改需要大約1000萬個細胞,一個單獨的測試。 這個巨大的需求幾乎排除這樣的患者樣本分析。

遠超過十年,張陸,弗吉尼亞理工大學的化學工程教授一直從事開發(fā)工具來有效地分析活細胞的長期目標,獲得更好的理解的一系列疾病。 在他的實驗室里和他的學生發(fā)展小微流控設備,測微計特性研究細胞內(nèi)分子事件。

微流體是科學的一個分支,處理性能,控制和治療的液體以某種方式受到限制。

最新的突破來自陸與Kai Tan愛荷華大學的合作,系統(tǒng)生物學家和內(nèi)科醫(yī)學副教授。 在一起,他們證明了一種叫做基于微流體振蕩清洗染色質(zhì)免疫沉淀反應(MOWChIP-Seq)允許分析epigenomic修改使用只有100個細胞。

美國國立衛(wèi)生研究院以及種子格蘭特從弗吉尼亞理工大學的關(guān)鍵技術(shù)與應用科學研究所資助的這項工作。

“使用填充床的珠子芯片允許我們收集的染色質(zhì)片段非常高的效率。 同時,有效的清洗去除不想要的分子和碎片保證收集到的分子的純度。 這兩個因素構(gòu)成一個成功的戰(zhàn)略epigenomic分析和極高的靈敏度。

整個MOWChIP過程大約需要90分鐘,而不是幾個小時,傳統(tǒng)芯片分析。

他們用他們的 技術(shù) 研究造血干細胞和祖細胞的表觀基因組與小鼠的胎兒。

譚說:“是知之甚少的動態(tài)表觀基因組在胚胎造血作用,很大程度上是由于很難隔離足夠數(shù)量的這些細胞發(fā)展embyros。 這種技術(shù)是完美的工具,用于解決這個問題。”

”我們的技術(shù)為研究鋪平了道路與極低的表觀基因組的細胞數(shù)量從動物和病人,”陸說。 由幾個國家衛(wèi)生研究院資助,該小組計劃使用這一技術(shù)來研究其他epigenomic改變參與炎癥和癌癥在不久的將來。

弗吉尼亞理工大學知識產(chǎn)權(quán)提起了一個實用專利MOWChIP-Seq代表。

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