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Nature子刊:蛋白質分析的強大工具

日期:2015-03-18 08:44:42

 科學家們一直對細胞中的蛋白質互作有著濃厚的興趣,因為蛋白質互作可以揭示最基礎的生命功能,比如細胞分裂。

 

歐洲分子生物學實驗室的科學家們開發(fā)了在活細胞中研究蛋白質行為的新技術,這項研究發(fā)表在三月十七日的Nature Biotechnology雜志上。這一技術首次允許人們實時跟蹤推動一個生物學過程的蛋白質網(wǎng)絡,可以用來研究特定疾病的發(fā)病機制,幫助制藥公司開發(fā)新的藥物靶標。

 

單分子檢測在生命科學領域有巨大的應用潛力,熒光相關光譜技術FCS)就是其中之一。FCS誕生于上世紀七十年代,主要通過熒光標記在活細胞中研究生物分子的動態(tài)。FCS可以檢測和定位不同蛋白質的動態(tài),這樣的數(shù)據(jù)具有很高的研究價值。不過FCS顯微分析相當麻煩,數(shù)據(jù)解讀也比較困難,目前還局限于少量蛋白的短期實驗。

 

為此,EMBL的研究人員開發(fā)了高通量的FCS技術(HT-FCS)。HT-FCS可以實現(xiàn)自動化的篩選、延時數(shù)據(jù)獲取和數(shù)據(jù)分析,是在活細胞中研究蛋白質組動態(tài)的有力工具。

 

“這一方法可以節(jié)省大量的時間,”文章的共同作者Malte Wachsmuth解釋道,“之前研究者可能要花一天時間在少量細胞中觀察一個蛋白,而我們可以自動在數(shù)千個細胞中獲得數(shù)十個蛋白的數(shù)據(jù)。”

 

為了展示HT-FCS的實用性,研究人員用該技術分析了53個核蛋白的動態(tài)。他們在一萬個人類活細胞中獲得了六萬個檢測值,并利用這些生理參數(shù)根據(jù)染色體結合和復合體形成情況對蛋白進行分類。

 

“我們將FCS開發(fā)成高通量技術,以便同時獲得大量蛋白的數(shù)據(jù)。這種能力對于研究生物學網(wǎng)絡很有幫助,因為生物學網(wǎng)絡通常包括幾十甚至幾百個組分,”Jan Ellenberg說。

 

研究人員認為,高通量和穩(wěn)健性能使HT-FCS得到廣泛的應用,幫助人們在活細胞中分析蛋白質網(wǎng)絡的動態(tài)。

 


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