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Cell:全面解析大規(guī)模癌癥基因組

日期:2014-10-24 08:43:33

 

來(lái)自癌癥基因組圖譜研究網(wǎng)絡(luò)(The Cancer Genome Atlas Research Network, TCGA)的研究人員針對(duì)甲狀腺癌thyroid cancer)進(jìn)行了綜合分析,鑒別出了一些侵襲性腫瘤的標(biāo)記物,這有可能為給予個(gè)別患者適當(dāng)?shù)闹委煼椒ㄌ峁┝烁玫陌悬c(diǎn)。

 

研究結(jié)果表明,有可能可以基于一些遺傳標(biāo)記物將這一疾病進(jìn)行重新分類(lèi),推動(dòng)甲狀腺癌更多地受益于精準(zhǔn)施藥。

 

“對(duì)于甲狀腺癌基因組景觀的這一認(rèn)識(shí)將改進(jìn)它的分類(lèi),改善分子診斷。這將幫助我們將那些需要積極治療的患者與腫瘤不太可能會(huì)生長(zhǎng)或擴(kuò)散的患者區(qū)分開(kāi)來(lái),”密歇根大學(xué)醫(yī)學(xué)院病理學(xué)教授Thomas J. Giordano博士說(shuō)。

 

在過(guò)去的30年里甲狀腺癌的發(fā)病率提高了3倍,它是美國(guó)最快速增長(zhǎng)的癌癥。盡管這些腫瘤通常生長(zhǎng)緩慢,且結(jié)合手術(shù)、甲狀腺激素和放射性碘很容易進(jìn)行治療,一些患者將會(huì)形成更為侵襲性和致命性的甲狀腺癌。

 

在這一發(fā)表在《細(xì)胞》(Cell)雜志上的文章中,研究人員分析了近500個(gè)甲狀腺癌樣本,鑒別出了所有起作用的遺傳突變。他們發(fā)現(xiàn)了一些新的癌基因以及現(xiàn)有基因的一些新變異。

 

研究人員發(fā)現(xiàn),總的來(lái)說(shuō),甲狀腺基因組相對(duì)平靜,相比于其他常見(jiàn)的癌癥相關(guān)遺傳突變要少一些。這或許可以解釋為什么這一疾病通常會(huì)生長(zhǎng)緩慢。

 

更少的突變意味著,研究人員能夠檢測(cè)相關(guān)的一些信號(hào)通路,了解是什么驅(qū)動(dòng)了甲狀腺癌。這種方法幫助了他們了解更多甲狀腺癌的遺傳驅(qū)動(dòng)因子,將“暗物質(zhì)”案例(攜帶未知遺傳驅(qū)動(dòng)因子的癌癥)比例從25%降到了3.5%。

 

這些驅(qū)動(dòng)因子可以分為兩個(gè)主要的致癌組:BRAF加相似的突變,以及RAS加相似的突變。但在這兩組內(nèi),尤其是BRAF組中,存在幾個(gè)不同的甲狀腺癌亞型。當(dāng)前,所有與BRAF相關(guān)的甲狀腺癌都被認(rèn)為基本上是一樣的。事實(shí)并非如此。

 

Broad研究所癌癥基因組計(jì)算部主任Gad Getz說(shuō):“這項(xiàng)研究整合了各種各樣的基因組數(shù)據(jù),不僅鑒別了癌癥驅(qū)動(dòng)因子,還比較了這些不同驅(qū)動(dòng)因子的行為。有趣的是,我們發(fā)現(xiàn)一些BRAF突變甲狀腺癌亞型是通過(guò)不同的機(jī)制來(lái)驅(qū)動(dòng)癌癥,其中一些亞型與更高風(fēng)險(xiǎn)、低分化的癌癥相關(guān)。”

 

研究人員利用這一認(rèn)識(shí)建立了測(cè)度或評(píng)分,可以確定一個(gè)腫瘤如何發(fā)生信號(hào)以及它的侵襲性。研究人員在一項(xiàng)臨床試驗(yàn)中測(cè)試了這些評(píng)分,以評(píng)估是否可促成更具針對(duì)性地治療建議。

 

國(guó)立人類(lèi)基因組研究所基因組醫(yī)學(xué)部項(xiàng)目主任Carolyn Hutter博士說(shuō):“這些研究結(jié)果意味著醫(yī)生和患者將在處理癌癥診斷和治療方面邁出重要的一步。世界各地的研究人員將利用這一數(shù)據(jù),返回到數(shù)據(jù)中來(lái),提出其他的一些科學(xué)問(wèn)題。”

 

對(duì)于病理學(xué)和科學(xué)群體初步的建議是,考慮基于分子亞型對(duì)甲狀腺癌進(jìn)行重新分類(lèi),以更好地反映它們的潛在分子特性。這將使得醫(yī)生能夠?qū)⒕徛L(zhǎng)的腫瘤與侵襲性腫瘤區(qū)分開(kāi)來(lái),推薦適當(dāng)?shù)闹委煛?span lang="EN-US">

 

癌癥基因組圖譜是一個(gè)得到聯(lián)邦政府資助的項(xiàng)目,旨在了解各種癌癥類(lèi)型的分子特征。這一項(xiàng)目已經(jīng)發(fā)表了一些癌癥類(lèi)型,如乳腺癌、結(jié)腸癌、卵巢癌和肺癌的許多標(biāo)志性論文。甲狀腺癌是納入最大樣本量的研究之一,研究了近500個(gè)腫瘤。

 


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